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系统发育树构建PPT;
;;;找到建树目的基因（基因组）
进行多序列比对;ClustalX （序列比对软件）
ModeltestMrModeltest(碱基替换模型筛选软件)
PHYLIP
MEGA
PHYML
PAUP
BEAST
Figtree (树形显示软件）
TreeView （树形显示软件）;Distance-based methods 基于距离的方法
Unweightedpair group method using arithmetic average (UPGMA) 非加权分组平均法
Minimum evolution(ME)最小进化方法
Neighbor joining(NJ)邻位归并法
Character-based methods 基于特征的方法
Maximum parsimony(MP)最大简约法
Maximum likelihood method(ML)最大似然法
计算速度
距离法 最大简约法 最大似然法
;;系统发育树建立方法;;;;;;;CLUSTALX－是CLUSTAL多重序列比对程序的Windows版本。Clustal X为进行多重序列和轮廓比对和分析结果提供一个整体的环境。 序列将显示屏幕的窗口中。采用多色彩的模式可以在比对中加亮保守区的特征。窗口上面的下拉菜单可让你选择传统多重比对和轮廓比对需要的所有选项。
Clustalx比对结果是构建系统发育树的前提 ;具体步骤;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;此课件下载可自行编辑修改，仅供参考！ 感谢您的支持，我们努力做得更好！谢谢
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