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克隆质粒的复制子以及在宿主菌的拷贝数
质粒,其复制子以及在 E. coli 宿主内的拷贝数
质粒类型 复制子 拷贝数
pUC18 pMB1* 500-700
pKS(-) ColE1 300-500
pBBR1系列载体 pBBR1 30-40
pBAD322,pET等系列载体 pMB1-rop 15-20
pACYC系列载体 p15A 10-15
pSC101衍生载体 pSC101 5-10
~15 (pir 宿主菌如 BW25141) pKD4, pR6KMCS R6K ~250 (pir-116 宿主菌如 BUN20) pJB866 RK2-trfA (oriV) medium
opBADTcTypeG pMB1 120 copies at 37C pECBAC1 oriS 1~2 Genome One copy
拷贝数是指每个细胞中有多少个质粒 DNA的分子,质粒的拷贝数直接决定了 :
从菌液中获得质粒 DNA的量。拷贝数和量成正比关系
以之为载体时转化子的数目。拷贝数的高低和转化子的多少成正相关,是否线性不确切 3. 筛选用抗生素的浓度。拷贝数的高低和抗生素的使用浓度成正相关,如 100,g/ml 的氨苄
青霉素筛选 DH10B/pKS(-),也可以用 50,g/ml;50,g/ml 筛选
DH10B/pBAD322;15,g/ml
筛选整合至基因组上的抗性基因。
当菌株的筛选和培养出现非预期的情形,适当地调整抗生素的浓度就非常重
要。
TaKaRa MiniBEST Plasmid Purification Kit Ver.2.0 (Code:DV801A)
提到
4
ml 的过夜培养的菌液中可纯化得到
20 ,g
质粒,以此推断,
1.5ml
过夜培养含高
拷贝质粒如
pKS(-)
的菌液中可得到多于
5 ,g
质粒,如溶于
50 ,l TE/ddHO
,则浓
度约
100ng/,l
。可参照此标准,来根据
2
不同拷贝数的质粒来推算本实验需要多少菌体、所提取质粒的量,再通过电泳
后与分子量标准的比较来进一步估算出的 DNA浓度。同样复制子的质粒,分子量较
大的质粒较分子量小的质粒所得到的量要略少。
以 pSC101-BAD-gbaA为例说明低拷贝质粒的试剂盒提取方法,采用 TaKaRa
MiniBEST Plasmid Purification Kit (DV801A) 。
o 挑取新鲜培养的抗性平板上的 3~5 个菌落至 5ml LB-3,g/ml Tc, 30C,
220rpm, 20h, 培养至溶液浑浊,
小量提取 ( 酶切鉴定及转化等 ):
1.5ml 毫升离心三次收集 4.5ml 的菌体至一个 EP管,按 Kit 方法进行质粒
提取 [2] 30,l
预热的 elution buffer
洗脱, 1,l
检测,适量酶切
2.
大量提取 ( 作载体或分离片段以构建克隆 ) o[1] 4ml
转接至 60ml LB-
3ug/ml
Tc, 30C, 220rpm, ~8h,至溶液浑浊
2 个 30ml 分至 2 个 50ml 离心管, 5000rpm, 5min ,弃上清,再离心后,吸去残液。分
别以 800,l solution I 悬浮,每 200,l 分装至一个 EP管,按 Kit 方法进行质粒提取。 [3] 每两管溶液过一个吸附柱 ( 共四个 ) ,分别以 30,l 预热的 elution buffer 洗脱,合并体积
为 120,l , 1,l 检测,适量酶切
上述两种方法均可通过真空干燥以减少体积同时增加浓度。
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