SARS病毒研究应用概述.docVIP

SARS冠状病毒研究概述 [摘要]：本文分为两个部分，第一部分是对SARS冠状病毒在分类学、形态学以分子遗传机制进行一个总体介绍，第二部分是针对SARS诊疗和抗SARS病毒新药研究思绪来进行叙述。 关键词：SARS 冠状病毒 诊疗 新药研究思绪 自11月中旬以来，严重急性呼吸综合症（severe acute respiratory syndrome，SARS）首先出现在中国广东省，接着在中国香港、台湾、加拿大、新加坡、美国和欧洲相继出现，以至演变为一场席卷全球风暴。这场风暴给整个社会带来了巨大冲击力，同时给全球经济带来了严重损失。大家和SARS打起了一场看不到硝烟战争。在1980年，科学家用了两年时间发觉AIDS病原是HIV，在，WHO成立了一个由全球10个国家和地域13个试验室组成合作研究网络，在两个星期后正式宣告一个以前未知冠状病毒，为引发严重急性呼吸综合症病原体，并命名为SARS冠状病毒。继SARS病毒分离成功和病毒全基因组测序成功以后，科学家们对SARS研究关键围绕以下多个方面：用生物信息学方法对SARS 冠状病毒基因组进行诠释，SARS诊疗和SARS病毒疫苗研制，寻求抗SARS药品。下面对研究情况进行概述。 SARS病毒概述 SARS病毒分类学地位 SARS 冠状病毒(SARS-Cov)，属于巢状病毒目(Order：Nidovirales),冠病毒科(Family：Coronaviridae)，冠状病毒属(Genus：Coronavirus)。依据其基因组结构分类，它属于单链正义RNA 病毒，病毒基因组约为30Kb，是全部RNA病毒中最大基因组。 在SARS病毒以前，人类共发觉了大约15种不一样冠状病毒。这些已知冠状病毒，依据血清学证据和种属发生学规律，分为3 个Group。其中Group1来自牛等动物，Group2包含猪、老鼠等哺乳动物冠状病毒，Group3仅有鸟感染性支气管炎病毒(Avian infectious bronchitis virus, IBV)。5月，《The Genome Sequence of the SARS-Associated Coronvirus》和《Characterization of a Novel Coronavirus Associated with Severe Acute Respiratory》发表在《Science》上，两篇文章共同点全部是经过对SARS冠状病毒全基因组完整测序，来对SARS病毒基因组注释。文章作者全部认为它基因组结构和其它3个种群冠状病毒有一定相关性，不过，经过比较遗传史和序列比对表明SARS－cov特征和已知三类冠状病毒特征并不完全相同，包含两种人类病毒HCoV-OC43和HCoV-229E在内多个冠状病毒中任何一个，它不仅表现有其它冠状病毒共有特征，还有SARS－CoV本身特有特征，所以认为新病毒组成了冠状病毒第4个株系（第4组），是一个新冠状病毒，从而形成一个独特group(Paul Marco,)。 一样，发表在New England Medicine两篇文章也支持了这个见解，在已知基因片段中，它和已知冠状病毒核酸水平同源性不超出50％，而氨基酸水平同源性在75％左右；在进化树分析中，和已知冠状病毒距离很远(Drosten Ksiazek,)，所以认为这是一个全新冠状病毒。下图为SARS冠状病毒和其它冠状病毒种系进化关系图： 图1：种系发生关系图（from Microbiology Immunology） SARS冠状病毒形态和结构 病人样本和培养细胞上清负染透射电镜扫描显示了多晶体、密封冠状病毒颗粒，其直径在60-130nm之间。大部分但并非全部病毒颗粒显示出这种特征性表面喷射状，酷似中世纪欧洲帝王王冠(crown)结构，由此而产生了该病毒名字，正是其“名字” Coronavirus 起源（corona在拉丁语中=冠状）。下面是冠状病毒结构图。 图2：冠状病毒结构图(from Kathryn V.,Holmes, ) 如上图所表示，已知冠状病毒粒子包膜上关键有三种糖蛋白：S蛋白、E蛋白和M蛋白。 纤突为Ｓ蛋白（Spike protein）,呈“棒棒糖”状膜蛋白，由两个domain组成，靠近N端部分形成一个球状domain，靠近C端部分形成一个穿膜棒状结构。对已知冠状病毒研究已经证实，Spike protein和冠状病毒侵入细胞过程亲密相关。 M蛋白(Membrane protein)是一个跨膜糖蛋白,其大部分在包膜内,仅有糖基化小部分暴露在双层脂质外面,在病毒包膜形成和出芽（budding）过程中起关键作用。 E蛋白（Envelope protein）是一个相对较小蛋白，散布在包膜上。 部分冠状病毒有HE蛋白（Haemagglutin