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引物查询方法
一共有两种查询引物的方法,包括 primerbank 和 primer3 ,当我
们查到引物时,我们需要用 Pubmed 来验证。详细说明见下文。
1.Primerbank
用引物银行查询引物时,我们只需要输入引物的名称,种属
网址:
1.将 search by 修改为
keyword
2.将 species 修改为您
所需要的种属,如
mouse
3.输入您所需查的基因
的名字,如atg5
4.点击 submit
您将得到所需查的基因的引物
的结果
点击这里,您将看到引物在编码
序列中的位置
点击这里绿色的部分,您可
以看到这个引物的 Qpcr 的
结果
2.primer 3
使用这个工具之前您需要在 Pubmed 中查到您的目的基因的序列,然后黏贴到
primer3中,软件便会自动设计引物。
Pumed 的使用方法如下:
网址:
修改为 nucleotide
输入您的目
的基因,如
atg7
最后单击search
点击这里选种属
筛选符合您需求的,我们
是自噬相关的 atg7 ,因此
选这个
点击 fasta 选项
这就是您所要的序列,
复制
Primer3
网址: 打开 primer3 的网址
修改为 None
黏贴如在pubmed 中查到
的基因序列
选中 pick left 和 pick right
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