花生种子大小相关性状及基因表达QTL定位分析.pdfVIP

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2021-01-09 发布于江苏
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花生种子大小相关性状及基因表达QTL定位分析.pdf

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花生种子大小相关性状及基因表达QTL 分析目录摘要 i Abstract iv 缩略语表 vii 1 文献综述 1 1.1 研究问题的由来 1 1.2 植物种子大小的调控途径研究进展 5 1.3 花生种子大小相关性状QTL 定位研究进展 7 1.3.1 花生遗传图谱构建的研究进展 7 1.3.2 花生种子大小相关性状QTL 定位研究进展 9 1.4 基因表达数量性状位点定位研究进展 12 1.4.1 基因表达数量性状位点概述 12 1.4.2 植物eQTL 定位研究进展 13 1.5 本研究的目的与意义 15 2 材料与方法 16 2.1 实验材料与田间种植 16 2.2 种子大小相关性状表型的考察 16 2.3 未成熟种子转录组测序 16 2.3.1 样品RNA 的制备 16 2.3.2 文库的构建 17 2.3.3 转录组测序及数据的质控 17 2.4 未成熟种子基因表达量变异分析 17 2.5 花生遗传图谱的构建 18 2.6 种子大小相关性状和基因表达的QTL 定位 18 2.7 eQTL 热点区分析 19 3 结果与分析 20 3.1 花生RIL 群体种子大小相关性状的表型变异 20 3.1.1 种子大小相关性状在不同环境下的表型变异 20 3.1.2 表型超亲家系的挖掘 23 3.2 花生RIL 群体未成熟种子基因表达量遗传变异 24 3.3 基于转录组测序的花生遗传图谱构建 26 3.4 花生种子大小相关性状QTL 定位 30 3.4.1 花生种子长QTL 定位 30 3.4.2 花生种子宽QTL 定位 30 3.4.3 花生百仁重QTL 定位 34 3.4.4 种子长、种子宽、百仁重QTL 共定位 35 3.4.5 百仁重条件QTL 分析 36 3.5 花生基因表达QTL 定位 39 3.5.1 花生基因表达QTL 定位 39 3.5.2 基因表达量QTL 热点区41 3.6 群体转录组学数据在花生紫皮候选基因挖掘上的应用46 4 讨论52 4.1 花生RIL 群体未成熟种子基因表达的遗传分析 52 I 华中农业大学2019 届博士研究生学位（毕业）论文 4.2 花生遗传图谱的构建53 4.3 花生种子大小相关性状的QTL 54 4.4 花生RIL 群体eQTL 定位55 4.5 群体转录组数据在花生性状候选基因挖掘上的应用55 参考文献57 附录72 附录1 94 个热点区的信息72 附录2 紫皮主效QTL 区间内设计的223 个SSR 引物在亲本之间的扩增信息75 附录3 在读期间发表的论文81 致谢82 II 花生种子大小相关性状及基因表达QTL 分析摘要花生（Arachis hypogaea L. ）是我国重要的油料作物和经济作物，是食用植物油和蛋白质的重要来源，在国民经济和社会发展占有重要地位。进一步提高花生单产是满足我国植物油日益增长需