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苎麻Lhc 基因的鉴定和表达模式研究 目录 摘要I Abstract III 缩略词表 V 1 前言 1 1.1 苎麻概述 1 1.2 苎麻光合作用及抗逆研究 1 1.3 捕光叶绿素a/b 结合蛋白基因家族 3 1.3.1 Lhc 蛋白家族的分类及功能结构特点 3 1.3.2 Lhc 家族基因的鉴定 5 1.3.3 Lhc 基因的表达分析 5 Lhc 基因的时空表达模式 5 Lhc 基因的非生物环境应答 6 1.4 Lhc 基因启动子 8 1.4.1 启动子结构及分类 8 1.4.2 Lhc 启动子及其顺式作用元件研究 9 1.5 苎麻基因以及特异型启动子的研究进展 10 1.5.1 苎麻基因克隆及应用 10 1.5.2 苎麻特异型启动子的研究进展 11 1.6 研究目的与意义 11 2 材料与方法 13 2.1 实验材料 13 2.1.1 植株与菌株 13 2.1.2 试剂与仪器 14 2.2 基于转录组数据库筛选苎麻Lhc 基因 14 2.3 苎麻Lhc 基因相关序列克隆 15 2.3.1 苎麻总DNA 提取 15 I 华中农业大学2020 届硕士研究生学位（毕业）论文 2.3.2 克隆引物设计 16 2.3.3 PCR 体系及程序设置 16 2.3.4 PCR 产物克隆及连接转化 17 2.3.5 测序结果分析 18 2.4 苎麻Lhc 基因生物信息学分析 18 2.4.1 基因结构和蛋白聚类 19 2.4.2 蛋白质性质 19 2.4.3 启动子预测筛选 20 2.5 苎麻Lhc 基因的表达分析 20 2.5.1 苎麻材料培养及处理 20 2.5.2 RNA 提取与cDNA 合成 22 2.5.3 荧光定量分析 23 引物设计 23 反应体系及程序设置 23 荧光定量数据分析 23 2.6 苎麻Lhc 基因启动子特异性表达验证 24 2.6.1 GUS 表达载体构建 24 2.6.2 表达载体转化农杆菌及鉴定 25 2.6.3 拟南芥的遗传转化 25 拟南芥种植 25 拟南芥转化 26 2.6.4 抗性植株筛选及鉴定 27 抗性植株筛选 27 抗性植株鉴定 27 2.6.5 转基因植株GUS 组织化学染色 28 3 结果与分析 29 3.1 苎麻Lhc 基因筛选 29 3.2 苎麻Lhc 基因及蛋白质生物信息学分析 30 3.2.1 苎麻Lhc 基因编码区序列 30 II 苎麻Lhc 基因的鉴定和表达模式研究 3.2.2 基因聚类 31 3.2.3 蛋白保守结构及理化性质 33 3.2.4 启动子位置及元件 39 3.3 苎麻Lhc 基因表达模式 42 3.3.1