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生物芯片平台简介 生物医学研究院 基因组与表观基因组子平台 工程技术员：郑枫芸 2015-5-26 博奥 Innopsys 晶芯®SmartArrayerTM 136 InnoScan 710 微阵列芯片生产系统 生物芯片扫描仪 生物芯片 • 75*25mm • 12*4个点阵 生物芯片技术简介 • 生物芯片技术的检测原理基于核酸杂交，是从传统 Northern blot或Southern blot基础上演变而来的。 原理 对照样品 实验样品 点样针 探针 基片 5 生物芯片的应用 种类 Array-based CGH analysis （比较基因组杂交芯片） DNA Methylation detection array （甲基化检测芯片） SNP detection array （单核苷酸多态性分析芯片） HLA typing array （HLA分型芯片） Gene expression profiling array （表达谱芯片） RNA Micro RNA array （小RNA芯片） Transcription factor profiling array （转录因子活性谱芯片） Protein Promoter array （启动子芯片,ChIP-GLAS） Protein array （蛋白芯片） Electrorotation chip （电旋转细胞芯片） Cell Neurochips （细胞网络电生理芯片） 7 Tissue Tissue array （组织芯片） 主要的生物芯片检测方式 • RNA表达谱：基于杂交检测。 • DNA比较基因组，aCGH ：基于杂交检测。 • DNA分型，SNP ： – 基于杂交方式(Affy SNP 6.0) – 基于连接方式(Affy CHB) – 基于单碱基延伸方式(Illumina Infinium 12) – 基于等位基因特异性延伸和连接方式(Illumina Goldengate) • DNA甲基化： – 基于甲基化抗体富集(MeDIP)-杂交(Roche NimbleGen) – 基于单碱基延伸方式(Illumina Infinium 1) • 蛋白芯片，基于蛋白间作用，如抗体芯片ELISA原理。 蛋白表达：抗体芯片检测 + 抗体芯片： 待检测样品： 表面固定各种抗体 含有待检测蛋白 样品和芯片 + 孵育，清洗： 生物素标