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5.超速离心 * 超速离心法(ultracentrifugation)既可以用来分离纯化蛋白质也可以用作测定蛋白质的分子量。 *蛋白质在离心场中的行为用沉降系数(sedimentation coefficient, S)表示,沉降系数与蛋白质的密度和形状相关 。 因为沉降系数S大体上和分子量成正比关系,故可应用超速离心法测定蛋白质分子量,但对分子形状的高度不对称的大多数纤维状蛋白质不适用。 6.氨基酸序列分析 * 超速离心法(ultracentrifugation)既可以用来分离纯化蛋白质也可以用作测定蛋白质的分子量。 *蛋白质在离心场中的行为用沉降系数(sedimentation coefficient, S)表示,沉降系数与蛋白质的密度和形状相关 。 分析已纯化蛋白质的氨基酸残基组成 测定多肽链的氨基末端与羧基末端为何种氨基酸残基 把肽链水解成片段,分别进行分析 测定各肽段的氨基酸排列顺序,一般采用Edman降解法 一般需用数种水解法,并分析出各肽段中的氨基酸顺序, 然后经过组合排列对比,最终得出完整肽链中氨基酸顺 序的结果。 通过核酸来推演蛋白质中的氨基酸序列 按照三联密码的原则推演出氨基酸的序列 分离编码蛋白质的基因 测定DNA序列 排列出mRNA序列 * * 一个共价分子是极性的,是说这个分子内电荷分布不均匀,或者说,正负电荷中心没有重合。分子的极性取决于分子内各个键的极性以及它们的排列方式。在大多数情况下,极性分子中含有极性键,非极性分子中含有非极性键 。然而,非极性分子也可以全部由极性键构成。只要分子高度对称,各个极性键的正、负电荷中心就都集中在了分子的几何中心上,这样便消去了分子的极性。这样的分子一般是直线形、三角形或四面体形。分子的极性对物质溶解性有很大影响。极性分子易溶于极性溶剂,非极性分子易溶于非极性溶剂,也即“相似相溶”。蔗糖、氨等极性分子和氯化钠等离子化合物易溶于水。具有长碳链的有机物,如油脂、石油的成分多不溶于水,而溶于非极性的有机溶剂 。 * * 中性氨基酸只含有1个羧基和1个氨基,在形成蛋白质分子时都被结合掉,因此根据其侧链R有无极性再分为中性极性氨基酸和中性非极性氨基酸二个亚类,中性极性氨基酸(polar AA)较亲水(hydrophilic),中性非极性氨基酸(non-polar AA)较疏水(hydrophobic) 在化学中,极性指一根共价键或一个共价分子中电荷分布的不均匀性。如果电荷分布得不均匀,则称该键或分子为极性;如果均匀,则称为非极性。物质的一些物理性质(如溶解性、熔沸点等)与分子的极性相关。 非极性是指电负性相等的元素原子对共用电子对的吸引力相等,形成化学键的电荷不发生偏移(重合),极性则相反。 * * 所有氨基酸及具有游离α-氨基的肽与茚三酮反应(氧化脱羧脱氨)都产生蓝紫色物质,只有脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应产生黄色物质。 * * 指存在于脑组织中的各种肽。在脑内作为神经传递物质或神经传递修饰物质,而起着重要作用,对活体具有许多作用。有神经叶激素、各腺性脑下垂体激素的释放激素或抑制激素、内啡肽、脑啡肽、 P物质、血管紧张素、神经细胞紧张肽、肠促胰酶肽以及胃泌素等。这些物质中很多是消化道激素,最近有人报道它们也存在于消化道中,不过其机能尚不清楚。另外有许多腺性脑下垂体激素,也在脑内发现,也应属于神经肽,这样,区别激素与神经传递物质(或者神经修饰物质)就困难了。但一般认为,同一种物质根据产生和分泌部位的不同,可以起激素作用,也可以起神经传递物质或修饰物质的作用。 * * 多肽链主链围绕中心轴做有规律的螺旋式上升,螺旋走向为顺时针(右手螺旋).肽单位(肽平面)围绕N-Cα 键旋转57°(Phi角) 或绕C-Cα键旋转47°(Psi角).氨基酸侧链伸向螺旋外侧.每3.6个氨基酸残基上升一圈(360°),螺距为0.54nm.每个肽键的N-H和第四个肽键的C=O形成与长轴平行的氢键. * * Mb:17.8kDa,153AAs single chain, the globular Pr, ?-helix(A-H), Heme; Hb: 64.5kDa;Differ at 83% AAs;Very similar 3D, ? chain 141AAs, βchain 146AAs * * 氧饱和曲线与氧分压的关系呈S型曲线,表明在第1个亚基与O2结合后其他亚基与O2的相继结合越来越容易,第4个亚基的氧结合常数可比第1个的大数百倍。这是因为第1个亚基结合O2后引起血红蛋白分子的构象变化,促使其他亚基与O2结合。O2的释放过程也是如此,第1个O2释放使留下的O2更易释放 血红蛋白氧饱和度为50%时的氧分压称为P50,是反应氧释放功能、Hb与O2亲和力的常用指标,正常情况下
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