氢化酶及其模拟物最新研究进展剖析.pdfVIP

氢化酶及其最新研究进展 1 氢化酶的定义及分类 1.1 氢化酶的定义 微生物的能量代谢过程中常伴随着质子还原和氢气的氧化过程，经过研究 人们发现，在这些微生物体内存在一种蛋白酶，能够催化氢气和质子之间可逆 的氧化还原过程，这种酶被称为氢化酶 (Hydrogenases,简称为 Hases);也称为氢酶， + - 是存在于微生物体内可逆催化氢气氧化还原反应 (反应为 H2 2H +2e ) 的一类 生物酶 [1] 。 1.2 氢化酶的分类 目前人类已经发现并且提纯了多种氢化酶， 各种氢化酶在它们的蛋白结构和 所利用的电子载体的种类 （如铁氧化还原蛋白、红素氧化蛋白等） 上有着很大的 差异 [1] 。 据氢化酶活性中心所含金属原子的不同，氢化酶主要分为三种类型 [2] ： (1)[FeFe]氢化酶 ,存在于细菌和低等真核细胞中，如藻类和原生生物，可以可 逆地催化质子和氢气之间氧化还原过程， 但一般认为其主要功能是催化质子还原 产氢，对氧气较为敏感 [2] 。 (2)[NiFe] 氢化酶，存在于大多数细菌，许多古生菌和藻氰菌中，最初的研究 认为这种酶的主要功能是催化氢气氧化，但后来发现有些 [NiFe] 氢化酶也是良好 的产氢催化剂；这类酶中有些含有 Se，被称为 [NiFeSe]氢化酶 [2] 。 (3)[Fe]氢化酶，这类酶只存在于产甲烷的古生菌中， 酶中不含 Ni 原子和 [FeS] 簇，它不能直接催化氢气和质子之间的氧化还原过程， 它的功能是在氢气存在下 可逆地催化 methenyl-H4MPT+还原产生 methene-H4MPT 和质子，这一反应过程 是微生物体内二氧化碳转化成甲烷的一个中间步骤 [2] 上述三种酶中， [FeFe]氢化酶的催化效率最高， 约为其他两种的 10-100 倍[1] 。 [NiFe] 氢化酶在自然界中含量最丰富，人们对其研究最为广泛和深入而根据氢化 酶的催化特性，可将氢化酶分为吸氢酶放氢酶和双向氢酶等类型 [2] 。 2 氢化酶的活性中心 2.1 [NiFe] 氢化酶的活性中心结构 [3] 1996年，Voldeba 等人对 D.gigas菌中 [NiFe] 氢化酶做了高分辨率的晶体解析， 活性中心的结构基本确定： NiFe 氢化酶活性中心是一个 Ni-Fe 异双核结构，与 Ni 配位的为四个半胱氨酸，其中两个通过半胱氨酸的 S 原子作为端基配位，另 外两个则通过半胱氨酸的 S 原子与 Fe 相连， Fe周围不再有其他蛋白配体，而是 - 有一个 CO 和两个 CN 作为端基配位， Ni-Fe 间还有一个含氧配体参与成桥。这 - 样 Ni 为五配位的四方锥构型， Fe 为六配位的变形八面体，两个 S 与两个 CN 在 赤道平面上， CO 与 O 处于轴向， Fe周围的强场可导致 Fe 保持低自旋。 图 2.1 不同氧化态的 [NiFe] 氢化酶的活性中心结构 2.2 [FeFe]氢化酶的活性中心结构 [3]