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三、Chem3D的使用 2、3D模型的种类 (1)Wire Frame 操作: [View]—[Model Display] —[Display Mode] —[Wire Frame] 三、Chem3D的使用 2、3D模型的种类 (2)Sticks 操作: [View]—[Model Display] —[Display Mode] —[Sticks] 三、Chem3D的使用 2、3D模型的种类 (3)BallStick 操作: [View]—[Model Display] —[Display Mode] —[BallStick] 三、Chem3D的使用 2、3D模型的种类 (4)Cylindrical Bonds 操作: [View]—[Model Display] —[Display Mode] —[Cylindrical Bonds] 三、Chem3D的使用 2、3D模型的种类 (5)Space Filling 操作: [View]—[Model Display] —[Display Mode] —[Space Filling] 三、Chem3D的使用 2、3D模型的种类 (6)Ribbons 操作: [View] —[Model Display] —[Display Mode] —[Ribbons] 这种模型结构一般用于生物大分子 三、Chem3D的使用 2、3D模型的种类 (7)Cartoons 操作: [View] —[Model Display] —[Display Mode] —[Cartoons] 这种模型结构一般用于生物大分子 三、Chem3D的使用 3、3D模型的建立方法 (1)利用键工具建立模型 1)单击工具栏上的“单键”按钮 2)将椎鼠标移动至模型窗口,按住鼠标左键拖出一条直线,放开鼠标即成乙烷(C2H6)立体模型。 3)将鼠标移至C(1)原子上,向外拖出一条直线,放开鼠标即成丙烷(C3H8)立体模型。 4)将鼠标移至C(2)原子上,向外拖出一条直线,放开鼠标即成丁烷(C4H10)立体模型,如图所示。 三、Chem3D的使用 3、3D模型的建立方法 (2)利用文本工具建立模型 输入一组氨基酸的缩写,可建立多肽的3D结构。如输入“H(Ala)12OH”,得到如图所示的模型。 输入文本,按“ENTER”键,得到模型 三、Chem3D的使用 若化合物带有支链,可以将支链用括号括起来。 异丁烷模型可输入“CH3CH(CH3)CH3”。 异戊二烯3D模型可输入“CH2C(CH3)CHCH2”。 4-甲基-2-戊醇 3D模型可输入“CH3CH(CH3)CH2CH(OH)CH3”。 3、3D模型的建立方法 (2)利用文本工具建立模型 三、Chem3D的使用 3、3D模型的建立方法 (3)利用子结构(Substructure)建立模型 Chem3D提供了子结构库,用户可以选择其中的子结构,然后将它们拼装起来,形成复杂结构。 操作: [View]—[Parameter Tables]—[Substructure], 选定所需要的子结构后,右键“Copy”, 然后在菜单栏上按“Paste”,获得3D模型 三、Chem3D的使用 3、3D模型的建立方法 (4)利用右侧作图区建立模型 操作: 在右侧的左图区左图,操作与ChemDraw类似,右侧画出结构时,左侧会同时出现对应的3D模型 三、Chem3D的使用 3、3D模型的建立方法 (5)利用模板建立模型 操作: [File]—[Sample File], 然后选择所需要的模板, 之后可根据自己需要添加官能团 图例:富勒烯(C-60) 三、Chem3D的使用 3、3D模型的建立方法 (6)ChemDraw平面结构转换成3D模型 1)ChemDraw结构式转换成3D模型 i)在ChemDraw中绘出乙烷的平面结构式; ii)选中结构式,复制到Chem3D的窗口中,Chem3D自动将平面结构式转变成3D模型 2)直接打开ChemDraw文件 i)[File]—[Open],弹出[Open]对话框 ii)在[文件类型]窗口中选择“ChemDraw (*.cdx ;*chm)”类型。 iii)单击打开按钮打开文件。Chem3D自动将ChemDraw文件转换为3D模型。 同理,3D模型也可以转换为平面结构式 i)选中3D模型 ii)执行[Edit]—[Copy As]—[ChemDraw Structure]菜单命令,复制此模型 iii)粘贴至ChemDraw窗口中。 三、Chem3D的使用 4、显示3D模型的信息 (1)显示3D模型的元素种类及序号信息 操作: [View] —[Model Display] —[Show Atom Symbols] [Show Serial
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