3.2 蛋白质的结构.pdf

3.2 蛋白质的结构 3.2.1 蛋白质的一级结构（primary structure ） • 3.2.1.1 一级结构 ：即蛋白质的化学结构，是指多肽链上 各种氨基酸残基的种类和排列顺序，也包括二硫键的数目 S S A Gly Ile Val Glu Gln Cys Cys Ala Ser Val Cys Ser Leu Tyr Gln Leu Glu Asn Tyr Cys Asn 5 10 15 2 1 S S S S B Phe Val Asn Gln His Leu Cys Gly Ser His Leu Val Glu Ala Leu Tyr Leu Val Cys Gly Glu Arg Gly Phe Phe Tyr Thr Pro Lys Ala 5 10 15 20 25 30 牛胰岛素的一级结构 3.2.1.2 一级结构的测定 准备 （纯化蛋白质、分子量测定、pI测定、Aa组成） 拆开二硫键 （氧化法、还原法） 分析已纯化氨基酸残基的组成 （离子交换、C端测定） 末端氨基酸的测定 （N端测定、C端测定） 肽链水解成片段 （胰蛋白酶法、胰凝乳蛋白酶法、溴化氰法） 肽段氨基酸排列顺序的测定Edman降解法 3.2.2 蛋白质结构层次 蛋白质结构极其复杂，但具有明显的结构层次 一级结构（多肽链上的氨基酸排列顺序） 二级结构（多肽链主链骨架的局部空间结构） 超二级结构（二级结构单位的集合体） 结构域（多肽链上可以明显区分的球状区域） 三级结构（整个多肽链上所有原子的空间排布） 四级结构（由球状亚基或分子缔和而成的集合体） 图3-10 蛋白质结构层次示意图 3.2.3 蛋白质的高级结构 3.2.3.1 肽单位平面与二面角 (1) 肽平面（peptide plane） 肽链主链的肽键C-N具有双键的性质， 因而不能自由的旋转，使连接在肽键上的六个原子共处于一个平面上， 此平面称为肽平面，又称酰胺平面。 (2) 二面角（dihedral angle) ：肽平面的连接处为α碳原子。 Cα-N之间称φ角， 在Cα-C之间称ψ角， 图3-12 相邻二个肽平面上的二面角 二面角决定了相邻肽平面的相对位置。 3.2.3.2 蛋白质高级结构中的化学键 （1）非共价键 氢键 离子键 范德瓦尔力 疏水作用 （2） S-S键 3.2.4 蛋白质的二级结构 二级结构（secondary structure）：指多肽链主链 在一级结构的基础上进一步的盘旋或折叠，形成的周期性构 象，维系二级结构的力是氢键。 二级结构主要形式有 α-螺旋、β-折叠、β-转角、无规卷曲等 3.2.4.1 α-螺旋（α-helix） 肽链主链骨架围绕中心轴盘绕成螺旋状，称为α-螺旋。 (Pauling and Corey, 1951)  典型的α-螺旋的结构是 1）外观似棒状，肽链的主链绕Cα相继旋转 一定角度，形成紧密的螺旋，侧链伸向 外侧 2）每3.6个氨基酸残基上升一圈,每圈使轴 上升0.54nm(0.15nm/氨基酸残基) 3）每一个氨基酸残基上的亚氨基氢（N-H） 与前面第四个氨基酸残基上的羰基氧 (C=O)之间形成链内氢键