八第一章蛋白质结构及功能.pptVIP

2. β-折叠 β-折叠（β-pleated sheet）是蛋白质分子中肽链相对伸展的一种结构形式，其主链通过肽键平面折叠成锯齿状。一个折叠单位含两个氨基酸，R基交替排列在β-折叠两侧。 同一条肽链内的若干肽段或不同肽链之间所形成的数段β-折叠可以平行结合，形成裙褶样结构。相邻β-折叠主链骨架的C=O和H–N之间形成氢键，使其构象稳定。 数段结合的β-折叠可以是同相平行，也可以是反向平行。 * * β-折叠（β-pleated sheet）结构示意图 * * 3.β-转角 β-转角（β-turn）是指蛋白质分子中，肽链形成180°的回折，构成一个转角。 一个β-转角由4个氨基酸构成，其中第1个氨基酸残基的C=O与第4个氨基酸残基的H–N之间形成氢键，使构象稳定。第2个氨基酸常为脯氨酸。 * * β-转角（ β-turn）结构示意图 * * 4.无规卷曲 无规卷曲（random coil）是指蛋白质分子中的某些肽段，其走向没有规律可循，肽链的肽键平面不规则排列，形成较为松散的二级空间结构。 * * 5.超二级结构 超二级结构（super secondary structure）又叫模体（motif）或基序，是指二级结构单元进一步聚集和结合形成的特定构象单元，如αα、βαβ、βββ等。 超二级结构是蛋白质从二级结构延伸到三级结构的一个新的结构层次，如螺旋-环-螺旋（HLH）、亮氨酸拉链和锌指结构。 * * 超二级结构 * * 亮氨酸拉链 * * 亮氨酸疏水R基 DNA 锌指结构 * * His His Cys Cys Zn B A 三、三级结构 三级结构（tertiary structure）是指在二级结构基础上，多肽链中相距较远的侧链R基通过相互作用进一步盘绕成特定的、不规则的空间构象，其包括了主链和侧链所有原子的空间排布。 维系三级结构的化学键主要有疏水键、氢键、离子键和范德华力等非共价键及二硫键等少量共价键。 蛋白质的多肽链在形成三级结构时，其非极性的疏水侧链形成疏水核，而大多数极性基团则分布在分子的表面，形成亲水区。 * * 1.部分蛋白质的三级结构 人肌红蛋白：153个氨基酸构成，包括8段α-螺旋（78%）及无规卷曲和β-折叠。整个分子呈球形，内部几乎都是疏水基团，极性基团位于表面。分子结构有一凹陷的口袋区，结合有一个血红素辅基。 牛胰核糖核酸酶：124个氨基酸构成，4个二硫键，3段较短α-螺旋和3段较长β-折叠。 * * 肌红蛋白 * * 牛胰核糖核酸酶 * * 2.结构域 许多较大蛋白质的三级结构中存在一个或多个稳定的、相对紧密的且在构象上常明显可区分的球状区域，这种结构称为结构域（domain）。 结构域与结构域之间常由无规卷曲的松散肽段相连，可通过适当酶切与分子其他部分分开。 一个结构域常常由一个外显子编码，可有几十个至几百个氨基酸残基组成。 同一蛋白质分子中的各结构域相对独立，并且具有不同的生理功能。 * * Src结构域 （为蛋白酪氨酸激酶） * * 四、四级结构 由两条或更多的多肽链构成的蛋白质分子，还要具备四级结构（quaternary structre）才具有活性。 在四级结构中，每一条肽链都有特定且相对独立的三级结构，称为该蛋白质的一个亚基。 多个亚基之间按照特定的方式以非共价键结合，形成特定的空间结构，称为蛋白质的四级结构。 在四级结构中，亚基与亚基之间通过疏水键、氢键、离子键和范德华力等非共价键相互作用而聚合在一起。 * * 血红蛋白四级结构示意图 血红蛋白由4个亚基构成的异四聚体，包括两个α-亚基，两个β-亚基。 * * 蛋白质一、二、三、四级结构示意图 * * （B）二级结构（α-螺旋） （A）一级结构 （C）三级结构 （B）二级结构（β-折叠） （D）四级结构 血红素辅基 五、维持蛋白质分子空间构象的主要化学键 1.氢键 氢键（hydrogen bond）是蛋白质分子中最多的非共价键。是指当氢原子与电负性很强的原子相连时，会带上部分正电荷，与另一带部分负电荷的原子产生静电引力。 2.离子键 离子键（ionic interaction or ionic bond）又称盐键（salt bridge），是带正电荷的基团与带负电荷的基团之间所产生的静电引力。 * * 五、维持蛋白质分子空间构象的主要化学键 3.疏水键 疏水键（hydrophobic interaction）是指两个疏水基团为了避开水相而相互聚集在一起的作用力。 4.范德华力 范德华力（Van der Waals interactions