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GeneMapper 软件 微卫星分析中文简易操作手册 微卫星分析流程： 设定微卫星分析方法： 登录软件 创建分析所需 kit 、 panel 和 marker 等参数； 创建新文件，导入数据； 设置分析参数； 分析并检查结果： 1. 编辑分析方法； 2. 分析数据； 打印并导出数据（可选） 1. 打印结果； 软件术语介绍： 术语 定义 Analysis Parameters 软件中分析样品所使用的特定设置；用于计算片段大小和基因 型，这些特定设置包括 analysis method, size standard 和 panel bin 在 marker 内设定等位基因的片段大小和颜色 bin set 等位基因特定实验条件下一组 bin  marker 微卫星标记，通过位点名称、片段大小、荧光标记和重复长度 进行设定 panel Marker 组合 kit panel 组合 一． 设定微卫星分析方法： 1. 登录 GeneMapper软件： 1.1 选择开始 -- All Programs -- Applied Biosystems -- GeneMapper--打开软件；GeneMapper GeneMapper-- 打开软件； GeneMapper ；或双击桌面快捷方式 1.2 登录 GeneMapper软件：用户名默认为 gm，在 Passwprd 中输入密 码，点击 OK进入 GeneMapper软件 2 创建分析所需 kit 、panel 和 marker 等参数 : 点击软件上方工具栏 Tools ，选择 Panel Manager ； 在 Panel Manager 对话框中，选中 1 Panel Manager ，点击 2 新建 Kit ；于 New Kit 对话框中依次输入 Kit 名称， Kit 类型，并点击 OK保存设置；  在 Panel Manager 对话框中，选中 1 STR KIT ，点击 2 新建 Panel ；3 中输入 Panel 名称； 选中 1 STR panel ，点击 2 新建 Marker ，在 3 位置依次输入 Marker Name （Marker 名称） ，Dye Color （ 荧光标记种类 ） ，Min Size ，Max Size （ 片段最小值和最大值 ） ， Marker Repeat （ 重复次数 ） ； 2.5 重复步骤，完成所有 Marker 设置， 点击 OK保存； 3. 创建新文件，导入数据： 3 .1点击 1 新建文件夹，在 2 Project Type 中文件夹类型选择 3 .1 Microsatellite ，点击 OK； 导入数据：点击 1 Add Samples To Project 添加数据，在弹出的对话框中选 择待分析数据，通过 3 Add To List 添加到右边的面板中，点击 4 Add 完成数据添加； 4. 设置分析参数： 完成数据添加后，在 1 位置， Analysis Method 中选择 New Analysis Method 新建分析方法；在弹出的对话框中选择分析类型 2 Microsatellite ， 点击 OK确认； 点击 1 General 点击 1 General ，填写 2 ，在将 4 Bin Set 选择 设置分析参数：在 Analysis Method Editor 中， Name（分析方法名称）；之后点击 3 Allele 修改 none；其它参数为软件默认，不需要 点击 OK确认； 选定好之前设定的分析方法，在后续的栏目中设定 Panel 和 Size Standard （分子量内标）； 完成分析参数设定后，选中 Analysis Method ，Panel 和 Size Standard 栏 目，点击 1File ，选择 2Fill Down ；此时， Analysis Method ，Panel 和 Size Standard 栏目会使用之前选定的分析参数；也可以使用鼠标分 别选择； 保存分析文件：点击 File ，选择 Save Project ，输入文件夹名称： 5. 执行初始分析： 点击分析按钮 1 点击分析按钮 1，分析数据： 在 1 Genotypes 中查看初步分析结果，或通过 2 Display Plots 选项查看样 品分型图： 在样品分型图界面中， Plot Setting 选择 Microsatellite Default ；通过软 件上方的快捷按钮编辑数据显示方式： 6 创建 Bin Set ： 打开 Tools —Panel Manager ，选中 1 STR Kit ，点击 2 新建 Bin Set ，在弹 出的 New Bin Set 对话框 3 中输入 Bin