一种用于检测基因组目标区域的引物组合物及其应用发明专利.pdfVIP

一种用于检测基因组目标区域的引物组合物及其应用发明专利.pdf

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(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 107365867 A (43)申请公布日 2017.11.21 (21)申请号 201710786937.X C12N 15/11(2006.01) (22)申请日 2017.09.04 (71)申请人 天津华大医学检验所有限公司 地址 300308 天津市东丽区空港经济区环 河北路80号空港商务园东区E3楼 申请人 广州华大基因医学检验所有限公司  深圳华大基因股份有限公司 (72)发明人 宋炎 张乐橦 刘磊 李普均  张盼 王晶晶 李志隆 刘继龙  叶明芝  (74)专利代理机构 北京品源专利代理有限公司 11332 代理人 巩克栋 (51)Int.Cl. C12Q 1/68(2006.01) 权利要求书3页 说明书16页 序列表4页 附图8页 (54)发明名称 一种用于检测基因组目标区域的引物组合 物及其应用 (57)摘要 本发明涉及一种用于检测基因组目标区域 的引物组合物及其应用,具体涉及通过血浆游离 DNA和数字PCR检测肺癌的EGFR突变位点的引物 组合物,及其组成的检测试剂盒及应用。本发明 引物组合物对应相同的模板区域,在同一扩增反 应中发挥作用,能够保证扩增特异性前提下提高 扩增效率,适用于扩增低拷贝数的短片段模板, 且所述引物组合物具有高灵敏性,能够检测EGFR 基因23种热点低频突变,需要样本量低,适用于 血浆等液体样本检测效果好,还可兼顾完整基 因。 A 7 6 8 5 6 3 7 0 1 N C CN 107365867 A 权 利 要 求 书 1/3页 1.一种用于检测基因组目标区域的引物组合物,其包含: 第一组引物,所述第一组引物包含第一正向引物和第一反向引物,其中,所述第一正向 引物的3’端包含目标区域特异性正向引物,5’端包含第一核酸序列;所述第一反向引物的 3’端包含目标区域特异性反向引物,5’端包含第二核酸序列; 第二组引物,所述第二组引物包含第二正向引物和第二反向引物,其中,所述第二正向 引物包含第一核酸序列;所述第二反向引物包含第二核酸序列。 2.根据权利要求1所述的引物组合物,其特征在于,所述第一、第二核酸序列的长度分 别不超过所述目标区域特异性正向引物、反向引物的50%; 优选地,所述第二正向引物的3’端包含所述目标区域特异性正向引物5’端部分序列; 所述第二反向引物的3’端包含所述目标区域特异性反向引物5’端部分序列; 优选地,所述第二组引物的正向、反向引物的总长度不超过第一组引物的正向、反向引 物的90%; 优选地,所述第一组引物与所述第二组引物的Tm值相当,优选为相差不超过5℃,进一 步优选为相差不超过2℃; 优选地,所述第一、第二组引物的Tm值低于对应的探针Tm值,差异不小于5℃; 优选地,所述第一、第二组引物的Tm值分别为45-65℃,优选为55-62℃; 优选地,所述第一组引物的3’端目标区域特异性引物长度为14-40bp,优选为18-30bp; 优选地,所述第二组引物的3’端目标区域特异性引物长度为14-40bp,优选为18-30bp; 优选地,所述引物组的扩增产物长度为不小于30bp。

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