基于林麝养殖管理平台的林麝智能选配育种系统.docx

基于林麝养殖管理平台的林麝智能选配育种系统 摘要：针对当前林麝养殖管理、遗传育种智能化水平较低的现状，融合养殖管理技术与分子遗传学设计了林麝资源管理平台，支持林麝资源及林麝养殖的日常管理，并可以通过养殖过程数据、林麝遗传谱系数据和有效分子标记数据进行林麝智能选配育种；基于当前主流的“公司+农户”的养殖场景，采用Net Framework和SQL Server构建了B/S架构的平台软件系统，实现了养殖场管理、个体管理、品系管理、养殖过程管理、系谱分析绘制、亲缘系数计算、分子序列比对、个体/群体选配、可视化数据分析、系统配置等功能模块；通过测试发现，该平台功能完备、实现正确、人机交互界面友好，能够满足林麝日常养殖管理和配种选育需要，也可为改善林麝种质资源提供数据依据。 林麝是国家Ⅰ级重点保护野生动物，也是《濒危野生动植物种国际贸易公约》（CITES）附录Ⅱ物种，具有重要的生态、科研和药用价值，其雄麝香囊分泌的麝香是传统中药的重要原料，属于国家战略储备物资、专控商品。近年来，林麝栖息地遭到破坏、野生林麝资源锐减，人工养殖已成为保护、恢复、壮大林麝种群和永续利用天然麝香的根本途径。但传统的林麝养殖主要依靠经验和人工记录来管理跟踪林麝的养殖和繁育过程，数据少且可靠性低，导致林麝长期近亲繁殖、品质退化严重，使现存的种麝生产力下降，直接影响了人工养麝的规模化发展。本文将养殖管理与分子遗传学相结合，构建了一款专业林麝资源管理系统。在完成林麝养殖过程信息化管理的基础上，自动分析林麝遗传谱系及有效分子标记数据，使用亲缘关系和遗传距离等分子遗传育种方法弥补了传统育种方法的弊端，从而有效增强了养殖和育种的规范化、专业化和科学化水平，具有较强的实用性、科学性、经济性、安全性及先进性，有应用推广价值。1 需求分析从陕西省林麝规模化养殖的实际情况出发，林麝资源管理平台需要对养殖过程中涉及到的养殖场数据、林麝个体数据、父麝/母麝/子麝亲缘数据、疾病/交配/产仔等养殖数据、林麝个体分子标记数据进行存储和管理，实现林麝养殖管理信息化；同时平台需要能够对养殖管理数据进行分析，完成林麝系谱绘制、亲缘系数计算、分子序列比对和林麝育种选配，实现林麝智能选配育种。为了实现与现有其他工具、项目间的数据共享，林麝资源管理平台需使用陕西省林麝活体标记项目中统一分配的林麝耳标号对林麝个体进行识别和区分，建立数据库。基于以上需要，将林麝资源管理平台需求分为养殖管理需求、谱系管理需求、统计分析需求、系统管理需求四大功能模块。见图1。1.1 养殖管理功能模块采集和管理各养殖场信息、林麝品系信息、林麝个体信息、各林麝个体的产香数据/交配数据/病历数据、已标定的林麝个体分子序列数据，实现数据的录入、编辑、查看和搜索等功能，满足养殖场/企业实现林麝养殖的信息化管理要求，并完成数据采集、支撑谱系管理和统计分析功能的正常运行。1.2 谱系管理功能模块融合利用养殖管理功能模块采集的林麝个体数据、养殖过程数据、分子标记数据，自动进行林麝谱系分析和绘制、林麝间亲缘系数计算、林麝间分子序列比对和遗传距离计算，自动完成林麝个体或群体选配，从而增强育种的规范化、专业化和科学化水平，提高育种成功率和幼仔成活率。1.3 统计分析功能模块对养殖管理功能模块采集的不同区域林麝养殖数据进行统计分析，通过柱状图、折线图等直观形式展示区域内的林麝产业动态，可用于支撑养殖企业经营者、行业管理部门、相关科研机构进行决策和研究。1.4 系统管理功能模块包括用户及权限管理、平台数据备份与还原、平台参数配置、林麝产业资讯及公告发布等功能。除此之外，考虑到养殖点分散，人员水平及硬件条件不一，平台还需具备简单多样的访问方式和易于理解的操作界面，这主要通过平台的系统架构设计和方案选择来实现。2 系统设计2.1 架构设计资源管理系统一般有C/S和B/S两种网络架构，其中传统C/S架构本平台软件采用经典的3层体系结构，分为表现层、业务逻辑层和数据访问层，如图3。数据服务层使用数据库对结构化的林麝资源数据进行组织、存储和管理，是整个平台稳定运行的基础。表现层是整个平台与用户直接交互的部分，负责完成主流浏览器的适配、各种功能的模块划分、人机交互界面和交互方式的实现，是平台易用性的关键。业务逻辑层连接表现层和数据服务层，负责实现各个功能的具体逻辑算法，按照表现层发送的用户指令从数据服务层读取数据并进行处理，将处理结果反馈至表现层，是实现林麝资源管理平台各项功能的核心。代码实现上采用ASP.NET+C#+SQL Server的方案。ASP.NET2.2 数据服务层设计本平台使用SQL Server软件创建资源管理数据库，并在此基础上依据林麝养殖的实际情况设计了养殖场数据表（F