基因组测序技术和基因识别完整版.pptVIP

基因组测序技术和基因识别完整版;主要内容;一、基因组测序技术;1、鸟枪法;序列片段覆盖待测序列 序列片段之间也存在着相互覆盖或者重叠。 ;拼接过程;拼接过程;2、杂交测序法;;由测出的局部序列：GCAC、ACTG、CTGA、CACT，可以重构目标序列的互补序列GCACTGA ，从而得到目标序列 CGTGACT 。 可用求最大权值的哈密顿路径的方法求解。 也可用欧拉路径的方法求解，该算法较省时。 ;3、拼接软件;;;;;;;;;二、基因识别;基因识别是识别DNA序列上的具有生物学特征的片段，是基因组研究的基础。 基因识别是生物信息学领域里的一个重要研究内容 基因识别问题，在近几年受到广泛的重视 当人类基因组研究进入一个系统测序阶段时，急需可靠自动的基因组序列翻译解释技术，以处理大量已测定的但未知功能或未经注释的DNA序列 ;1、原核基因识别 原核基因特点：基因密度高、简单（绝大多数不含内含子）。其重点在于识别编码区域 ;非翻译区域（untranslated regions, UTR） 编码区域两端的DNA，有一部分被转录，但是不被翻译，这一部分称为非翻译区域 5’UTR---基因上游区域的非翻译区域 3’UTR---基因下游区域的非翻译区域 ;对于任何给定的核酸序列（单链DNA或mRNA），根据密码子的起始位置，可以按照三种方式进行解释。 例如，序列ATTCG