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- 2021-09-17 发布于广西
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TORCH -联合检测试剂盒标准操作规程
1 目的
明确TORCH-联合检测试剂盒检测的操作规程,指导检验人员正确进行基因芯片检测。
2 适用范围
2.1 适用于进行TORCH -联合检测的检验人员。
2.2 适合仪器:常规基因扩增仪、恒温杂交箱。
2.3 方法原理:采用PCR和DNA杂交相结合的DNA芯片技术。
2.4 样品要求:泌尿生殖道样本。
3 职责
实验操作人员应严格按操作规程进行实验。
4 试剂来源
《TORCH检测试剂盒》(昆明寰基生物芯片开发有限公司)。
5 质控物
阴性对照来源于试剂盒
6 检验方法
6.1 仪器和耗材
6.1.1 无菌操作台;
6.1.2 基因扩增(PCR)仪(适用0.2ml PCR薄壁管);
6.1.3 取样器(0.5-10μl、40-200μl、200-1000μl);
6.1.4 台式离心机(转速可达12,000rpm);
6.1.5 恒温培养箱(可恒温42℃)或可调42℃的保温台
6.1.6 水浴恒温振荡器(可恒温25℃);
6.1.7 载玻片架及玻片洗脱容器2个;
6.1.8 芯片激光扫描仪(Axon GenePix4000B);
6.1.9 PCR扩增所需一次性耗材。
6.2 检测前准备
6.2.1 芯片洗脱液配制(若10%SDS出现白色絮状沉淀,请于42℃条件加热至溶液透明后再使用)
6.2.1.1 在芯片洗脱容器中按照 蒸馏水(或纯化水): 20×SSC: 10%SDS =100:5:1 配制洗脱液Ⅰ,洗脱液配制总体积应满足浸没芯片;
6.2.1.2 在芯片洗脱容器中按照 蒸馏水(或纯化水): 20×SSC: 10%SDS =400:1:4 配制洗脱液Ⅱ,洗脱液配制总体积应满足浸没芯片;
6.2.1.3 洗脱液一次配制可连续使用15天,每个试剂盒中提供的洗脱液在一个月内用完。
6.3 样本处理
用移液器将20μl Protreinase K加入一个干净的1.5ml离心管中。
向离心管中加入200μl 样本,再加入200μl Carrier RNA 工作液。盖上管盖,漩涡振荡15S。
在56℃孵育15min,简短离心收集管壁及管盖上的液体。
加入250μl无水乙醇,盖上管盖漩涡振荡15S,在室温放置5min。
将离心管中的溶液全部转移至RNase-Free吸附柱,盖上管盖,8000rpm(-6000×g)离心1min,弃废液,将吸附柱放回收集管中。
打开盖子,加入500μl溶液RW,静置2min,8000rpm(-6000×g)离心1min,弃废液,将吸附柱放回收集管。
重复此步骤一次。
打开吸附柱盖子,加入500μl无水乙醇,8000rpm(-6000×g)离心1min,弃废液,将吸附柱放回收集管。
将吸附柱放回收集管中,12000rpm(-13000×g)离心3min,使吸附膜完全变干,弃废液。
将吸附柱放入一个RNase-Free离心管(1.5ml)中,打开吸附柱盖子,向膜中央加入20-150μlRNase-Free ddH2O,盖上盖子,室温放置5min。12000rpm(-13000×g)离心1min。
4 PCR扩增及标记
HPV检测按下表配制扩增-标记反应体系,按其循环参数在0.2ml PCR薄壁管中进行扩增和标记。
反应体系
循环参数
组份
加量(μl)
45℃ 15min×1 cycle;
94℃ 5min×1 cycle;
(94℃ 30s,57℃ 30s,72℃ 30s)×35cycles;
72℃ 5min×1 cycle;
95℃ 5min×1 cycle.
临床样本DNA,RNA或阴性参考品
4.5
PCR扩增试剂混合物
13
PCR扩增引物混合物
7.5
总体积
25.0
5 杂交
5.1 将恒温台或杂交箱开启升温恒定到42℃,用杂交模块将洗片固定好,预热10min。
5.2 将PCR 产物加热至95℃(置于PCR 仪中)变性5min,PCR 产物变性完毕取出后,立即冰浴3min。
5.3 取75μl经50℃预热的杂交缓冲液和25μl临床样本扩增-标记产物充分混匀,将混合物全部滴加在芯片矩阵位置,(操作过程中禁止触碰到微阵列区,避免产生气泡);
5.4 将保湿杂交盒水平放入42℃,恒温台上或恒温箱内杂交40min。
6 洗脱
将芯片放入洗脱容器中,在25℃恒温水浴摇床100rpm震荡条件下进行洗脱。洗脱流程:洗脱液Ⅰ,5min;洗脱液Ⅱ,5min。洗脱完毕后,将芯片自然晾干或用专用的玻片离心机甩干即可进行扫描。
7 扫描及结果判定
7.1 将干燥后的芯片置于激光扫描仪中使用532nm波长激光扫描(按说明书操作),获得扫描数据及图谱;
7.2 按照说明书要
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