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基因芯片的原理和应用第1页/共27页会计学第2页/共27页基因芯片 它利用核酸双链的互补碱基之间的氢键作用,形成稳定的双链结构,通过检测目的单链上的荧光信号,来实现样品的检测,以实现高速度、高通量、集约化和低成本的分析技术。 第3页/共27页0.2 mm什么是基因芯片第4页/共27页基因芯片的作用原理第5页/共27页Microarray ProductionContact Printing The laboratory of Patrick Brown at Stanford University Photolithography Affymetrix ( )Pin and Ring Genetic Microsystems Affymetrix第6页/共27页基因芯片与传统鉴定方法的比较传统方法每次鉴定单一样品常规的DNA Hybridization需几小时到几天时间对于大量样品的单独处理,极易产生误差基因芯片容量大速度快系统误差小第7页/共27页基因芯片技术流程第8页/共27页主要仪器设备第9页/共27页芯片杂交仪芯片点样仪芯片扫描仪第10页/共27页病原菌的种类Level 3: 12属33种(5种可常规检查)Level 2: 340种Level 1常见病原菌:約500种 72种为常见感染疾病病原菌第11页/共27页Genus of Mycobacterium第12页/共27页Genus of StreptococcusAbiotrophia S. agalactiae S. mitis S. oralis S. acidominimus S. suis S. pneumoniae S. intermedius 第13页/共27页Pathogenic micro-organism第14页/共27页禽流感病毒的检测HEXBCNCPCH1HA-1H1HA-2H1HA-3H1HA-4H1HA-5H1HA-6H1HA-7H1HA-8H1HA-9H1HA-10H1HA-11H1HA-12H1HA-13H1HA-14H1HA-15H1HA-16H1HA-17H1HA-18H1HA-19H1HA-20H1NA-21H1NA-22H1NA-23H1NA-24H1NA-25H1NA-26H1NA-27H1NA-28H1NA-29H3HA-30H3HA-31H3HA-32H3HA-33H3HA-34H3HA-35H3HA-36H3HA-37H3HA-38H3HA-39H3HA-40H3HA-41H3HA-42H3HA-43H3HA-44H3HA-45H3HA-46H3HA-47H3HA-48H3HA-49H3NA-50H3NA-51H3NA-52H3NA-53H3NA-54H3NA-55H3NA-56H3NA-57H3NA-58H3NA-59H5HA-60H5HA-61H5HA-62H5HA-63H5HA-64H5HA-65H5HA-66H5HA-67H5HA-68H5HA-69H5HA-70H5HA-71H5HA-72H5HA-73H5NA-74H5NA-75H5NA-76H5NA-77H5NA-78H9HA-79H9HA-80H9HA-81H9NA-82H9NA-83H9NA-84H9NA-85H9NA-86H9NA-87H9NA-88A-89A-90A-91A-92A-93A-94A-95A-96A-97A-98B-99B-100B-101B-102B-103B-104B-105B-106PCNCBCHEX第15页/共27页 (1) (2) (3) (4) (5)禽流感病毒的检测 部分毒株探针筛选芯片杂交结果(1)H1N1亚型流感病毒,(2)H3N2亚型流感病毒,(3)B型流感病毒,(4)H5N1亚型禽流感病毒,(5)H9N2亚型禽流感病毒 Typical chip results for probe selection(1) typical A/H1N1 image, (2) typical A/H3N2 image, (3) typical B image typical,(4) A/H5N1 image, (5) typical A/H9N2 image第16页/共27页104copies/μL 103copies/μL 102copies/μL 101copies/μL 100copies/μL禽流感病毒的检测基因芯片敏感性评价Sensitivity evaluation of microarray第17页/共27页基因芯片在微生物学中的应用第18页/共
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