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第二章核酸的结构与功能;核 酸(nucleic acid) ;核酸的分类及分布;第一节
核酸的化学组成及其一级结构The Chemical Component and Primary Structure of Nucleic Acid;;一、核苷酸是构成核酸的基本组成单位;碱基(base)是含氮的杂环化合物。;嘌呤(purine,Pu) ;;戊糖; ;核苷与磷酸通过酯键结合构成核苷酸;体内重要的游离核苷酸及其衍生物;二、DNA是脱氧核苷酸通过3 ?,5 ?-磷酸二酯键连接形成的大分子;5′-末端;三、RNA也是具有3’,5’-磷酸二酯键的线性大分子;四、核酸的一级结构;A ;DNA和RNA的区别;第二节
DNA的空间结构与功能Dimensional Structure and Function of DNA;一、DNA的二级结构是双螺旋结构; Chargaff 规则的碱基组成分析;两条多聚核苷酸链在空间的走向呈反向平行。两条链围绕着同一个螺旋轴形成右手螺旋的结构。双螺旋结构的直径为2nm,螺距为3. 4nm。
脱氧核糖和磷酸基团组成的亲水性骨架位于双螺旋结构的外侧,疏水的碱基位于内侧。
双螺旋结构的表面形成了一个大沟和一个小沟。 ;2.DNA双链之间形成了互补碱基对;相邻两个碱基对会有重叠,产生了疏水性的碱基堆积力(base stacking interaction)。
碱基堆积力(主要)和互补碱基对的氢键共同维系着DNA结构的稳定。;(三)DNA双螺旋结构的多样性;二、DNA的高级结构是超螺旋结构;(一)原核生物DNA的环状超螺旋结构;DNA超螺旋结构的电镜图象;;(二)真核生物DNA的高度有序和高度致密的结构;DNA染色质呈现出的串珠样结构。
染色质的基本单位是核小体(nucleosome)。;核小体的构成;;真核生物DNA在细胞核内的组装;DNA的基本功能是以基因的形式荷载遗传信息,并作为基因复制和转录的模板。它是生命遗传的物质基础,也是个体生命活动的信息基础。;第三节 RNA的结构与功能;RNA与蛋白质共同负责基因的表达和表达过程的调控。
RNA通常以单链的形式存在,但有复杂的局部二级结构或三级结构。
RNA比DNA小的多。
RNA的种类、大小和结构远比DNA表现出多样性。;RNA的种类、分布、功能;信使RNA(messenger RNA, mRNA)是合成蛋白质的模板。
其前体hnRNA含有内含子(intron)和外显子(exon)。
外显子是氨基酸的编码序列,而内含子是非编码序列。
寿命最短的RNA;;5?-末端的m7Gppp帽???结构
3?-末端的poly A尾。
从AUG 开始,每三个核苷酸为一组编码一个氨基酸,称为三联体密码(codon)。
成熟的mRNA由氨基酸编码区和非编码区构成。 ;mRNA功能:是蛋白质合成的模板;1、 tRNA的一级结构特点
含 10~20% 稀有碱基,如 DHU
3′末端为 — CCA-OH
;3. tRNA的三级结构— 倒L形;2.rRNA的结构:;核蛋白体结构;原核生物翻译过程中核蛋白体结构模式:;肽链延长;tRNA;四、其它小分子RNA及RNA组学;;;核酸的理化性质
The Physical and Chemical Characters of Nucleic Acid;核酸在波长 260nm 处有强烈的吸收,是由碱基的共轭双键所决定的。
这一特性常用作核酸的定性和定量分析。;240-290nm范围,最大吸收峰在260nm;1.DNA或RNA的定量
OD260=1.0相当于
50μg/ml双链DNA
40μg/ml单链DNA(或RNA)
20μg/ml寡核苷酸
2.判断核酸样品的纯度
DNA纯品: OD260/OD280 = 1.8
RNA纯品: OD260/OD280 = 2.0;;DNA热变性:;三、变性的核酸可以复性或形成杂交双链;只要两种单链分子之间存在着一定程度的碱基配对关系,在适宜的条件可以在不同的分子间形成杂化双链。
这种杂化双链可以在不同的DNA与DNA之间形成,也可以在DNA和RNA分子间或者RNA与RNA分子间形成。这种现象称为核酸分子杂交。;双链DNA1;第五节 核酸酶 Nuclease;依据底物不同分类
DNA酶(DNase):专一降解DNA。
RNA酶 (RNase):专一降解RNA。
依据切割部位不同
核酸内切酶:分为限制性核酸内切酶和非特异性核酸内切酶。
限制性核酸内切酶: 识别并切割特异核苷酸序列(回文结构)。
核酸外切酶:5′→3′或3′→5′核酸外切酶;Bam HⅠ;核酸外切酶;两种最重要的生物大分子比较
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