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* 第四节 系统聚类分析法 系统聚类分析法分为两类: 对变量分类,即R型分析; 对样品分类,即Q型分析。 * * 第四节 系统聚类分析法 系统聚类分析法基本步骤: 数据的正规化和标准化; 数据分类尺度计算; 分类树形图的绘制; 类别的划分。 * * 第四节 系统聚类分析法 数据的正规化和标准化 设原始监测数据为Xij(i=1,2,…,n; j=1,2,…,m; n为样品个数,m为变量个数),正规化或标准化处理后的数据为Zij(i=1,2,…,n; j=1,2,…,m) 正规化计算公式: * * 第四节 系统聚类分析法 数据的正规化和标准化 标准化计算公式: * * 第四节 系统聚类分析法 数据分类尺度计算--四种方法 相关系数R * * 第四节 系统聚类分析法 数据分类尺度计算--四种方法 相关系数R 一般用于变量的分类(R型); -1≤Rij≤1; Rij愈接近1两变量关系愈亲近; Rij愈接近-1两变量关系愈疏远。 相关系数: 0.8 - 1.0 极强相关 0.6 - 0.8 强相关 0.4 - 0.6 中等程度相关 0.2 - 0.4 弱相关 0.0 - 0.2 极弱相关或无相关 * * 第四节 系统聚类分析法 数据分类尺度计算--四种方法 相似系数S——把每个样品看做m维空间中的一个向量,n个样品相当于m维空间中的n个向量。第i个样品与第j个样品之间相似系数用两向量之间的夹角余弦表示: 一般用于样品间的分类(Q型); -1≤Sij≤1; Sij愈接近1相似性越好; Sij愈接近-1相似性越差。 * * 第四节 系统聚类分析法 数据分类尺度计算--四种方法 欧氏距离D——对每个样品,把它的m个因素(变量)的值看做m维空间中的一个点,则n个样品就是m维系空间中n个点,则第i个样品与第j个样品之间的距离为: 一般用于样品间的分类(Q型); 0≤Dij≤1; Dij愈接近0相关性越好; Dij愈接近1相似性越差。 * * 第四节 系统聚类分析法 数据分类尺度计算--四种方法 斜交空间距离D1 用于样品间的分类(Q型); 0≤D1ij≤1; D1ij愈接近0相关性越好; D1ij愈接近1相似性越差。 * * 第四节 系统聚类分析法 分类树形图绘制 绘制分类树形图的法则是使相似程度高的样本或样本所代表的类优先集中在一起,用较短的线联结起来,而相似程度低的样本或类之间用较长的线联结。 两种方法——一次形成分类法,逐步形成分类法 * * 第四节 系统聚类分析法 分类树形图绘制——一次形成分类法 首先选出相关系数最大的元素对,然后选出次大的元素对,依此类推。 选出元素对后,按下列规则将各元素对连接成群。 若两元素在已形成的群中未出现过,形成一个独立的群; 若两个元素中有一个在已经分好的群中出现过,则另一个加入该群; 若两个元素都在已分好的两群中,把两群相连; 若两个元素都在同一群中,则不作处理。 * * 第四节 系统聚类分析法 分类树形图绘制——逐步形成分类法 首先从距离矩阵中选出最小的元素DkL并归入一组,然后按下面方法进行计算: 把第k个样品与第L个样品的相应的各个变量取平均值代替第k个样品,并取消第j个样品,形成心的样品数据(比归并前减少了一个); 重新计算距离矩阵; 重复上面两个步骤; 进行n-1次则全部归并为一组,按归组的先后顺序及相应的距离大小作出分类树形图。 *
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