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分子水溶性估计 水溶性是药品透过生物膜, 进入血液循环境保护证。 logS表示, S代表一定温度下, 饱和水溶液浓度, 单位mol/L。 85%药品其logS在-1至-5之间 其它大部分小于-6 少数药品大于-1, 极性很大分子, 如糖和小分子肽。 其她估计方法 很多计算方法已应用于ADMET特征估计, 其中最常见方法包含基础统计学、构效关系以及愈加智能化研究路径, 如遗传运算法则和神经网络。 第二节 生物信息学 基因 蛋白质 药品 小分子 先导化合物 生物信息学 化学信息学 生物信息学概念 生物信息学 将计算机科学和数学应用于生物大分子信息获取、加工、存放、分类、检索与分析, 以达成了解这些生物大分子信息生物学意义交叉学科。 生物信息学关键是研究两种生物大分子, 即DNA和蛋白质分子。 文章如果有不当或者不妥的地方，请您联系我修改文章或者删除文章，文章来源于网络收集，如果有侵权的问题，请联系我沟通协调改正，非常感谢您！ 基于化学基因组学的药物设计 上世纪中叶, 科学家经过试验证实DNA是遗传物质; 随即DNA双螺旋结构、中心法则等一系列研究结果提出, 遗传信息携带者——基因——成为人类生命科学研究关键。 而人类基因组计划顺利完成, 使人类第一次在分子水平上全方面认识了自己, 以后开始了后基因组时代。 本章将从化学信息学入手, 关键对研究“从基因到药品”转改变学基因组学技术进行叙述。 化学 生命 科学 内容提要 第一节 化学信息学 第二节 生物信息学 第三节 化学基因组学与药品设计 第一节 化学信息学 一、化学信息学基础定义 二、化学数据分析和化学数据库创建 三、先导化合物发觉与结构优化 四、类药先导物筛选与ADMET 化学信息学是化学科学一门新、交叉领域分支学科, 它产生与发展是基于化学信息量指数般增加, 尤其是组合化学及高通量筛选快速发展。 化学信息学产生与发展是与药品研究与开发息息相关, 但它应用却覆盖了化学学科各个领域。对化学信息学研究也成为热门方向之一。 一、化学信息学基础定义 化学数据使用和管理以及计算机在化学计算中应用与在化学中引进信息概念早期研究是密不可分。 Gerg Paris认为: 化学信息学是一个通常术语, 它包含化学信息设计、建立、组织、管理、检索、分析、判别、可视化及使用。 相关化学信息学定义及研究领域, 现在中国外学者尚存在争议。 化学信息学 利用计算机及其网络技术: 对化学信息进行表述、管理、分析、模拟和传输; 实现化学信息提取、转化与共享; 揭示化学信息内在实质与内在联络学科。 ADMET 药品吸收、分布、代谢、排谢、毒性 经历了多年发展, 化学信息学已经取得了巨大成就: 为化学家们提供了很多必备工具(化学数据库、化学制图软件); 从传统研究领域(合成设计、结构解析、定量构效关系研究), 逐步扩展到部分新领域, (虚拟组合化学、虚拟筛选、ADMET、全新药品设计) 。 二、化学数据分析和化学数据库创建 2.1 化学数据分析 化学信息学是为处理化学领域中大量数据处理和信息提取任务而结合其她相关学科所形成一门新兴学科。 这门新兴学科是在化学计量学和计算化学基础上演化和发展起来, 并吸收和融合了很多学科精华。 化学计量学 利用数学、统计学、计算机技术以及其她相关学科理论与方法, 优化化学量测过程, 并从化学量测数据中最大程度提取有用化学信息。 QSAR quantitative structure-activity relationships 一个借助分子理化性质参数或结构参数, 以数学和统计学手段定量研究有机小分子与生物大分子相互作用、有机小分子在生物体内吸收、分布、代谢、排泄、毒性等生理相关性质方法。 计算化学是应化学数据定量分析需要而产生, 它为化学信息学提供数据计算和信息解析工具。 通常而言, 计算化学需要满足两个基础要求: ①正确求解问题; ②快速求解问题。 2.2 化学数据库创建 化学信息可分为与传媒相关信息及与物质相关信息。 化学信息形式包含: 文字、符号、数字、形貌、图形及表格等。这些化学信息最关键组织、管理形式是形成数据库。 化学数据库创建包含化学信息创建、存放和展示。 伴随人类进入后基因组时代, 化学信息学得到了飞速发展, 多种化学信息数据库创建也有很大发展。 世界上很多著名企业都建立了化学信息系统和化学数据库。中国科学院化学部也建有专门化学数据库。 多年来, 中国也非常重视中药数据库建立和完善, 并取得了初步结果。 数据库 分子文库计划（美国国家健康研究院） 小分子生物活性数据库（哈佛大学） 蛋白质结构信息集成检索数据