遗传距离专题知识.pptVIP

遗传距离专题知识;概念;将序列数据转化为距离分析优点: 1）序列本身极少有直观意义, 距离能直观而具体表示序列之间差异; 2）将序列转换成距离, 能够对各自对应不一样进化时间距离作对应校正。 3）距离矩阵方法运算速度快, 可用于大规模数据集系统分析。 缺点: 1）转化过程中部分系统发生信息丢失; 2）转化成距离数据后无法与其她类型性状数据联合分析; 3）只有经过性状分析才能识别特定有用性状（即序列位点）, 距离数据无法做到。;遗传距离计算方法;未校正遗传距离;总替换分歧度;转??/颠换替换分歧度;同义/非同义替换分歧度;校正遗传距离;基因组距离;计算遗传距离软件;系统树构建;系统树构建;基于距离矩阵系统树;距离树优点: 1）简单 2）稳定 缺点: 1）信息丢失 2）无比较次优树能力 3）统计学分析困难 建树软件: PAUP、MEGA、PHYLIP等;