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乌头简单序列重复区间扩增条件的优化
目录
TOC \o 1-9 \h \z \u 目录 1
正文 1
文1:乌头简单序列重复区间扩增条件的优化 1
1 材料 3
2 方法 3
3 结果 4
4 讨论 6
文2:甘草与乌头液对小鼠乌头毒量药动学参数的影响 7
1 材料与方法 7
2 结果 8
3 讨论 10
参考文摘引言: 10
原创性声明(模板) 11
文章致谢(模板) 12
正文
乌头简单序列重复区间扩增条件的优化
文1:乌头简单序列重复区间扩增条件的优化
Abstract:ObjectiveTo keep the stability of ISSR_PCR and reliability of genetic diveity, sibship analysis and source assessing for Aconitum carmichael Dexb. Methods23 kinds Aconitum carmichael Dexb. samples in southwest of China were selected to carry out 4 facto(Mg2+,dNTP,primer and Taq polymerase) and 3 levels(concentration) orthogonal design experiment. Meanwhile separated experiments for forma-mide, template concentration and annealing temperature affect were carried _PCR reaction system could be well established through orthogonal design experiment by 23 samples ISSR-PCR reaction optimized ISSR-PCR reaction system can be stably used for Aconitum carmichael Dexb. genetic analysis.
Key words:Aconitum carmichael Dexb.; Inter-Simple Sequence Repeat; Optimization
乌头Aconitum carmichael Dexb.为毛茛科乌头属植物,别名五毒根[1]。为毛茛科植物乌头,在 中国 西南地区四川盆地有较大栽培面积,其母根叫乌头或川乌,为镇痉剂,可用于治风痹、风湿神经痛。侧根(子根)入药,称附子(Radix Aconiti Lateralis Preparata)
ISSR-PCR技术,简单序列重复区间(Inter-Simple Sequence Repeat,ISSR),是Zietkiewicz等[2]1994年创建的,引物是根据基因组内某一重复序列设计出一系列特异性引物,包括双核苷酸、三核苷酸和四核苷酸等微卫星片段。这种技术除具有RAPD优点外,比RAPD技术更具有明确的针对性,同时由于PCR扩增条件中的退火温度较高(50℃左右),保证了PCR扩增的可重复性,结合了SSR和RAPD的优点。可以快速、高效和灵敏地检测出基因组DNA的多态性, 有很好的重复性, 操作简单、成本较低, 适合大样本的检测[3]。关于野生乌头的RAPD的优化与遗传分析已有报道[4],川乌ISSR遗传分析也有报道[5]。因此建立稳定好、重复性强的ISSR反应体系对乌头遗传学、种质资源、分类学与种系发生学等方面具有重要意义。
1 材料
从四川绵阳安县晓坝(海拔850 m)已建立的附子资源圃200份附子种质资源类型中筛选出优势代表材料23份(见表1),上年种植,200707采摘顶部功能嫩叶数片,置4℃保存,提取DNA所用。
表1 乌头样品引种来源(略)
2 方法
DNA提取采用陈亮[6]并稍加改良的CTAB方法提取DNA,通过紫外和琼脂糖电泳检测其纯度、浓度和完整性后,用以ISSR-PCR优化实验。
反应体系正交实验 采用L9(34)正交实验设计,对Mg2+(大连TaKaRa提供),dNTP(TaKaRa),引物(上海生工提供)和rTaq聚合酶(TaKaRa)进行4因素3水平[7]筛选,方案如表2。根据表2制备总体积为20 μl的反应体系,体系中还存在1×PCR缓冲液和30 ng模板DNA,其余用过柱超纯水补充,引物选用哥伦比亚UBC系列847号引物,在德国Eppendorf Mastercycler Gradient仪上扩增,PCR扩增程序为:94℃预变性3 m
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