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蛋白质、多肽、氨基酸;蛋白质是构成生物体的基本物质
图为电子显微镜下的蛋白质;2、1 蛋白质、多肽、氨基酸;氨基酸 蛋白质基本单元
多肽 氨基酸按一定方式连接而成的生物大分子。可单独存在,但一般作为蛋白质的亚单元
蛋白质 由一个或多个多肽链通过特别价键结合而成。
蛋白质的结构
基本组成、连接方式、空间结构;
氨基酸的结构和命名
蛋白质水解生成的氨基酸中有20种与核酸中的密码相应,用于在核糖体上进行多肽合成。这20种氨基酸中有19种为α-氨基酸,1种为亚氨基酸,其名称和缩写见表1。
在这些氨基酸中,除甘氨酸外,羧基的α-碳都是不对称碳原子。用酸或酶是蛋白质水解得到的氨基酸,除甘氨酸外都是旋光的,且都属于L-型,它们与L-甘油醛之间的关系为:;R的结构; 在苏氨酸和异亮氨酸中还有第二个不对称碳原子,这两种氨基酸的构型为:
; 蛋白质水解生成的氨基酸并不限于表1所列的20种,因为蛋白质酶的作用下,其中的氨基酸还能够其各种反应,水解后就生成相应的非典型的氨基酸,例如:;α-氨基酸的物理性质
α-氨基酸的熔点特别高,同时多数在熔化时分解,例如:甘氨酸的熔点为262℃(分解),酪氨酸的熔点为310℃(分解),因此,α-氨基酸的熔点不是一种能用于鉴定的可靠物理常数。与此相反,α-氨基酸的N-酰基化合物或酰胺的熔点却较低。例如:;蛋白质种类繁多,由20种基本氨基酸构成
α- 氨基酸
α-碳原子为手性中心(甘氨酸除外),均为L-构型
R为氨基酸的侧链,是氨基酸中的唯一可变化部分。
;α–amino acids的结构
;氨基酸分类;(1)酸性氨基酸;(a) Aspartic acid 天冬氨酸 (abbreviation:Asp);(b) Glutamic acid 谷氨酸
(abbreviation:Glu)
;(2)碱性氨基酸;(a) Lysine 赖氨酸
(abbreviation: Lys)
侧链:第二个氨基
四个亚甲基, 赋予蛋白质分子 柔性、挠曲性的氨基酸
;Hydroxyl sine 羟基赖氨酸
(abbreviation:Hylys)
这种氨基酸只在结缔组织的蛋白质中存在,如胶原;(b) Arginine 精氨酸
(abbreviation:Arg)
;精氨酸含有胍基
胍基:碱性最强的有机碱,碱性能够和氢氧化钠相比
在生理条件 pH(7、35),胍基完全离???化
精氨酸:碱性最强的氨基酸
;(c)Histidine 组氨酸
(abbreviation:His)
;组氨酸pKa最近生理pH值的一种氨基酸
组氨酸含有咪唑杂环
咪唑环同时弱酸、弱碱(特别好的亲核试剂)
咪唑环一侧的去质子化和另一侧的质子化同步进行
组氨酸可在生理条件解离、结合质子;咪唑环形成质子传递体系
;(3)Neutral Amino Acids中性氨基酸;(1) Glysine甘氨酸 最简单、没有光学活性的氨基酸
(abbreviation:Gly)
显然与这种氨基酸相关的化学反应比较少,在生物学上的意义主要是作为结构成份,大量的结构蛋白质如:胶原和丝素中含有大量的甘氨酸。;(2) Alanine 丙氨酸
(abbreviation:Ala)
;(3) Valine 缬氨酸
(abbreviation:Val)
;(4) Leucine 亮氨酸
(abbreviation:Leu)
;(5) Isoleucine 异亮氨酸
(abbreviation:Ile)
;含有芳香环侧链的氨基酸;(7)Tyrosine 酪氨酸
(abbreviation: Tyr)
羟基化苯丙氨酸
;这种氨基酸有可离解的酚羟基 pKa=10、07
苯丙氨酸和酪氨酸结构上的相似性允许前者在人体内向后者转化
苯丙氨酸非酪氨酸是膳食中的重要氨基酸,是合成激素和肾上腺的重要前躯体;(8) Tryptophan 色氨酸
(abbreviation:Try)
indole ring(吲哚环):杂环芳烃 五元吡咯环+六元苯环
;吲哚环是出色的π电子供体
色氨酸更易电荷转移复合物、电子重叠复合物;三种氨基酸共同点:共轭π电子体系
π电子供体:存在电子槽(“electron sink”),提供电荷转移复合物、或形成电子重叠复合物
;含有羟基hydroxylic or 硫mercapto的氨基酸含有羟基的基本氨
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