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转基因水稻多重PCR和Real-timePCR定性检测中的问题与策略(农学毕业论文资料)
文档信息
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转基因水稻多重PCR和Real-timePCR定性检测中的问题与策略(农学毕业论文资料)
文1:转基因水稻多重PCR和Real-timePCR定性检测中的问题与策略
DOI:/-.002
转基因技术应用于作物以来,转基因产品如玉米、大豆、棉花等都已有商业化的品种问世;目前在世界上使用最多的转基因商业化基因是抗除草剂基因和Bt杀虫基因。而水稻作为一种主粮,商业化步伐远远慢于这几种作物;目前最有可能商业化的转Bt杀虫基因的是中国与国际水稻所合作研制的“华恢1号”、“Bt汕优63”和欧洲研制的富含维生素A的Golden rice[1,2]
自从国家给转基因水稻发放了安全证书,转基因水稻的商业化成为了热门的议题。目前农业部发放安全证书的转基因水稻有抗虫转基因水稻“华恢1号”和“Bt汕优63”,国家制定了关于作物和转基因水稻的检测方法标准[1,3]。国家质量检测部门有完善的种子和食品检测系统,来定性检测是否含有转基因成分。但是随着转基因水稻即将大规模的种植,科研人员在研究和育种过程也有大量的样品需要检测,主要目的有以下几个:①更好地进行常规品种转基因育种工作,防止转基因的品种污染常规品种,保持种质的纯合,同时检测转基因的水稻在田间有没有发生漂移;②节省人力物力,大量的水稻样品送到专门的质检部门检测价格昂贵;③有些检测样品中的转基因成分元件,是超出国家质量标准检测范围的。
转基因作物和转基因食品的检测方法有很多,例如PCR、Southern Blot、基因芯片等[4-7]。常规和便捷的方法是普通PCR以及由其衍生出的半定量PCR方法[8,9];在国内外使用的最多定性作用更强的是Real-time PCR[10-12]。多重PCR检测方法被广泛使用[4]。本文根据自己的一些实践,总结出了在食品检验、科研或者育种工作中进行多重PCR检测分析转基因样品中的几个要点。
1 污染源的杜绝
转基因检测中,只有杜绝一切污染源,才有可能在后续的检测中做出正确的判断。如果没有做好防止污染,很容易出现假阴性和假阳性。因此所有的试剂须新鲜现配、灭菌,枪头、离心管等要严格灭菌,玻璃器皿需要清洗干净[13]。样品必须防止交叉污染,条件允许的话,可以进口高质量的离心管、枪头等,以便在后续的试验中起到排除污染的作用[12]
2 样品DNA的提取方法
DNA的提取方法既可以采用经典的CTAB方法,也可以按照农业部的质检标准书的方法,这两种方法用于PCR和半定量PCR、Real-time荧光定量PCR都有很好的结果[3,14];条件允许的话,也可以采用试剂盒。有学者采用快速提取法获得的转基因番茄DNA,用于Real-time PCR检测,取得了很好的结果;鉴于这一点,快速方法提取的转基因水稻DNA,也应该可以适用于Real-time PCR的检测,这就为检测大量的水稻DNA样品提供了便捷的途径[3,15-17]。Cankar等[18]、Demeke等[19]在水稻转基因检测的实践中,采取适用于RFLP分子标记检测的水稻DNA快速提取法,取得了比较好的效果。
3 转基因水稻的多重PCR检测
根据农业部的质检标准书,采用的是多重PCR和Real-time PCR的方法。在转基因的检测中,有4个检测元件:启动子、终止子、靶基因、内参基因。转基因的定性检测中,首先要检测的是内参基因,因为内参基因能确定DNA模板的质量;然后是检测启动子和终止子,在检测出启动子或者终止子以后,还要进一步检测靶基因。只有两个以上的转基因元件被检测出,才能定性为转基因的水稻[3,4,9,20]
3.1 内参基因的检测
在定性检测转基因水稻中,会设置内参基因,农业部的质检标准书采用的是水稻sps(蔗糖磷酸合成酶)基因[3,21];也可以采用常规试验中经常用的水稻β-Actin基因的引物(在不同的物种中高度保守,组织和细胞中的表达相对恒定内参基因的检测),可以对模板进行定性为水稻的DNA,同时可以根据PCR产物条带的亮度来确定模板的质量。
3.2 启动子的检测
3.2.1 CaMV 35S启动子的检测 根据农业部制定的质检标准书,在目前的转基因水稻中的定性检测一般检查的是花椰菜病毒35S启动子。早期的水稻转基因多采用这个启动子,这次农业部批准的“Bt汕优63”也是采用的CaMV 35S启动子。
3.2.2 含CaMV 35S启动子的转基因水稻和病毒感染的定性区分 转基因食品中CaMV 35S启动子中有一个关键性问题就
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