《生物信息学导论》.ppt

生物信息学导论Introduction to Bioinformatics;张举华;主要内容 ;生物信息学概述 ;概述 ; 概述 ; 概述 ; 概述 ; 概述 ; 概述 ; 概述 ; 概述 ; 概述 ; 概述 ; 概述 ; 概述 ; 概述 ; 主要内容 ;基因组信息学 ;基因组信息学 ;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学 ;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;;;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;◆ 序列的全局比对 打分方案： 其中，s(ai,bj)是序列1第i个位点的字母（核苷酸或氨基酸残基），ai与序列2第j个位点的字母 bj一致或不一致时所赋的分值， w是间隙（gap）罚分。这些分值取多少并无确切的值，比方说，可以给定如下方案： ;基因组信息学;1. 比对矩阵的初始化： ;2． 确定比对矩阵每一个单元的分值： ;基因组信息学;基因组信息学;3． 从比对矩阵的最右下角开始追溯分值路径（trace back）；;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学 ;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;基因组信息学;北京理工大学 生命科学与技术学院 ;Definition;What is Bioinformatics?;编辑课件;编辑课件;编辑课件;Why is bioinformatics hot?;….ACGTGGTTAAATCGTATGCTTAGCTACCCACGTGGTTAAATCGTATGCTTAGCTAGTTACGTGGTTAAATCGTATGCTTAGCTAGCCACGTGGTTAAATCGTATGCTTAGCTATTTACGTGGTTAAATCGTATGCTTAGCTACGCACGTGGTTAAATCGTATGCTTAGCTA………;Transcriptioninto RNA;Translationinto Protein;Protein Folding;What is a Gene?;Genome;ORGANISM ;Transcriptome;Proteome;Review of Proteins;Review of Proteins;Protein Structure;Protein Structure;Protein Structure;Protein Structure;Protein Structure;Differences between A.A.’s;Differences between A.A.’s;Secondary Structure;Secondary Structures;Secondary Structures;Types of Secondary Structures;? Helix;? Helix;? Helix;? Sheet;? Sheet;? Sheet;? Sheet;Interactions in Helices and Sheets;Loop;Loop;Coil;Secondary Structure;6 Classes of Protein Structure;6 Classes of Protein Structure;? Class Protein (hemoglobin);? Class Protein (T-Cell CD8);?/ ? Class Protein(tryptohan synthase);?+? Class Protein(1RNB);Membrane Protein (10PF);Protein Structure Databases;Protein Structure Databases;Partial PDB File;Description of PDB File;Protein Structure Classification Databases;Protein Structure Classificat