病原宏基因组高通量测序性能确认方案.docxVIP

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  • 2022-12-15 发布于甘肃
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病原宏基因组高通量测序性能确认方案.docx

病原宏基因组高通量测序性能确认方案 病原宏基因组测序(metagenome next- generation sequencing,mNGS),基于宏基因组学和高通量测序技术,可对各种临床标本中所有的病原体(包含细菌、真菌、病毒、寄生虫、支原体/衣原体等)进行无差别检测[1,?2]。mNGS适用于各种病原体的鉴定,特别是未知新发病原体,如新型冠状病毒等[3,?4],故在新发突发、复杂及混合感染的病原体实验室诊断中,有望提供重要的病原学诊断依据。由于mNGS仍然是一项较为前沿的技术,绝大部分相关研究多聚焦于其临床应用价值评价,分析性能确认领域相对空白[5,?6,?7]。鉴于mNGS测序的湿实验和干实验过程涉及的试剂、数据库、软件等暂无标准化要求,不同实验室病原宏基因组检测流程采取的方案存在一定差异[8,?9,?10]。因此,在实验室开展临床检测前,建议遵照美国临床实验室改进法案修正案(Clinical Laboratory Improvement Amendments,CLIA)和美国病理学家协会(College of American Pathologists,CAP)实验室管理相关指导文件,同时参考国家药品监督管理局(National Medical Products Administration,NMPA)、中国合格评定国家认可委员会(China National Accred

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