分子动力学模拟实例-扩散系数.pptxVIP

分子动力学模拟实例聚合物中分子扩散系数的计算模拟第1页，共24页。 分子动力学做扩散系数有两种方法：1. 计算体系的均方位移（Mean square displacement ＭＳＤ），然后根据Einstein关系求得扩散系数；2. 计算体系的速度自关联函数（Velocity auto-correlation function VACF)然后再通过Green-kubo关系计算体系的扩散系数第2页，共24页。 1、Getting startedBegin by starting Materials Studio and creating a new project.Open the New Project dialog and enter polymer_gas as the project name, click the OK button.The new project is created with polymer_gas listed in the Project Explorer. 第3页，共24页。 2. To set up the initial structures 第4页，共24页。 3. To build an amorphous cell Click the Amorphous Cell button on the Modules toolbar