分子生物学：基因、基因组与基因组学.pptx

基因、基因组与基因组学;1、基因;生物学定义： ——具有遗传功能的DNA片段。 分子生物学定义： ——DNA分子中含有特定遗传信息的核苷酸序列，是遗传物质的最小功能单位。合成有功能的多肽链或RNA所必需的全部核酸序列（通常是DNA序列）。;1.2基因的组成;1.3、基因分类;2、基因组;2.1 基因组的概念;2.2 基因组的种类与结构特点;2.2.2 基因组的大小;生物的基因组大小及其变化;; ; ;2.3 基因组结构与进化的关系：;2.4 原核生物基因组结构;2.4.1 原核生物基因组结构与功能的特点 1.基因组通常仅由一条环状双链DNA分子组成。 其DNA是与蛋白质结合，但并不形成染色体结构，只是习惯上将之称为染色体。细菌染色体DNA在胞内形成一个致密区域，即类核（nucleoid），类核无核膜将之与胞浆分开。 2.基因组中只有1个复制起点。 3.具有操纵子结构。 操纵子（operon） 是指数个功能相关的结构基因串联在一起，构成信息区，连同其上游的调控区（包括启动和操纵区）及其下游的转录终止信号构成的基因表达单位。 4.结构基因无重叠现象，基因组中任何一段DNA不会用于编码2种蛋白质。 5.基因序列是连续的，无内含子结构。;6.编码区和非编码区（主要是调控序列）在基因组中约各占50%。（5%，95%） 7.基因组中的重复序列很少。编码蛋白质结构基因多为单拷贝，但编码rRNA的基因往往是多拷贝的，这有利于核糖体的快速组装。（15AA/秒，2AA/秒） 8.具有编码同功酶的基因（isogene） 这是一类结构不完全相同，而功能相同的基因。如E.coli含有2个编码乙酸乳酸合成酶的基因和2个编码分支酸变位酶同工酶的基因。 9.细菌基因组中存在可移动的DNA序列，包括插入序列和转座子。 10.原核基因的基本结构特点： 启动子（promoter）、操纵基因（operator）、调控序列、结构基因（structure gene）、终止子（terminator）。;2.4.2大肠杆菌基因组结构：;2.5 真核生物核基因组;1.分子量大，比原核细胞大10倍以上。 2 多条，线状。 多复制起点 3、DNA与蛋白质结合，可以形成染色质结构 4、分为胞质区和核区，转录和翻译在实践和空间分隔。 5、重复序列 6、多为单拷贝基因 7、有跳跃基因 8、有内含子 ; 真???生物C值佯谬;2.5.2 基因的不连续性——真核基因的重要特征;鸡的卵清蛋白基因用EcoRⅠ和HindⅢ两种酶切，可得到3或4个片段，把该基因的mRNA逆转录产物cDNA（双链）用以上两种酶切，发现cDNA不能被这两种酶切。 ;(exon-intron-exon)n structure of various genes;螯肢动物sDscam基因通过选择性启动子及可变剪接相结合的调控方式产生惊人的同源异构体多样性;1）.结构基因、内含和外显子、断裂基因 （1）结构基因（structural gene）指能转录成为mRNA、rRNA或tRNA的DNA顺序。 （2）内含子和外显子 真核生物的结构基因是不连续的，编码序列被非编码序列打断，在编码序列之间的序列称为内含子（intron），编码序列称为外显子（extron）。 （3）断裂基因（split gene） 在真核类结构基因组中，编码顺序被许多称为内含子的非编码区分割成几段称之。;2）、基因内含子的特点：;I 类（group I intron） II 类（group II intron） III 类（group III intron） 核mRNA内含子（nuclear mRNA intron） 即剪接体内含子（spliceosomal intron） 核tRNA内含子（nuclear tRNA intron） 古细菌内含子（archaebacterial intron）;;4.内含子功能;真核生物DNA复性的各项参数;据基因组重复次数高低分类：;卫星DNA;卫星DNA通常是串联重复序列，由各种不同的重复序列家族组成。 重复单位常存在序列变异，反映卫星DNA可能在经过串联重复后发生突变、重复和缺失而得以进化。 在真核生物之间， satellite DNA 总量在2%~5%，甚至在亲缘关系密切相关的两个物种之间， satellite DNA也会有悬殊的差别。 ;分类;应用：;概念 在真核生物基因组中来源相同、结构相似、功能相关的一组成串排列在一起的基因，称为基因家族。一些基因彼此靠近，成串地排列在一起，这种基因排列结构叫基因簇。在基因家族结构中经常会看到基因簇结构。;2.6 线粒体基因组