电子科技大学《分子生物学》课件-第9章个体化医学.pptxVIP

第九章个体化医学Personalized Medicine电子科技大学《分子生物学》现代医学模式 (4 Letters P Medicine)生活方式疫 苗疗 养提前干预DNA 序列定期体检Preventive 预防Predictive 预测P1P2P4P3 病人了解疾病参与治疗 遗传变异 合适药物合适剂量，Participatory 参与Personalized 个体化药D医学治疗模式理想传统个性化处方药物经验性处方药物明确诊断药A药B确定、治疗药A尝试、更换药B药D药C药C安全、有效千人一个标准：医师的经验， 治疗差异，费时、金钱、疗效不能确定每人一个标准：分子检测结果，针对性治疗，节时、金钱，达到最好疗效药物临床研究和应用的相悖有效性（敏感性）安全性（毒副作用）用药对象个体临床试验对象群体基因and /or 环境？同一个药给不同的人为什么结果不一？药物作用存在个体差异为什么会有差异？基因决定的吗？SNPs存在差异测序结果表明：确实存在SNPs 药物遗传学： 药物基因组学： PharmacogeneticsPharmacogenomics单核苷酸多态 single nucleotide polymorphism, SNPSNP：人类基因组中，SNP大多为二等位多态。SNPs：形成DNA分子多态性。SNP：决定个体差异的最主要的遗传基础。疾病发生（易感、患病风险）与SNPs相关药物作用（敏感、耐药）与SNPs相关拷贝数变异/拷贝数多态性 Copy number variations, CNVsCopy number polymophisms, CNPs 基因组中大于1 kb 的DNA 片段插入、 缺失和/ 或扩增，及其不同组合而导致的复杂变异 DNA结构变化（单一片段的插入、缺失、扩增，等）； 染色体结构变化（插入、缺失、重复、易位，等）； CNVs 是一种新的可以作为疾病易感标志的基因组DNA多态性 临床遗传学家发现，至少有97%的疾病是散发的，而且不涉及任何基因的突变，仅仅源于CNVs不同个体DNA序列 99.9% 相同300万变异基因0.1%环境也存在差异疾病相关药物反应差异相关罕见的 CNVs 10%遗传99% 常见的 CNVs 90%1% 人群新生1%CNPsCopy number polymorphisms拷贝数多态性CNVsCopy number variations拷贝数变异Human vs HumanSNPsCNVs碱基对2.5 Mb4 Mb 1/1,200 bp1/800% 基因组0.08%0.12%在基因组中存在丰富的CNVs在健康个体中，大量的CNVs是遗传的，新生的 1%SNPsCNPsCNVs基因组的多态性（多样性）疾病复杂性 全基因组核基因组线粒体基因组检测SNPs测序：deep sequencing基因芯片：特异、灵敏、智能、高通量KaryotypingFISHQ-PCRMicrosatellite检测CNVsSNP array检测CNVsGenotype known common CNVs using whole-genome arrays（GWAS）array-CGH, CNV only, test vs reference Nimblegencustom or whole-genome (up to 2,1M probes)Affy 6.0940,000 CNV non-polymorphic probesHigh-density in ~5,600 CNV regions in DGV + extended to whole-genome36,000 CNV non-polymorphic probesIllumina 1Mcovering ~4,000 CNV regions in DGV个体化医学核心——基于个体基因组的诊断与治疗个体基因组全基因组序列：测序技术（通量，成本）全基因组关联性分析（GWA Study，GWAS）SNPs（单核苷酸多态性）CNVs（拷贝数变异，Copy Number Variations ）个体化医疗个体化诊断（基础）个体化治疗（个体化用药）个体基因组人类基因组计划引发生命科学研究数据的海量增长生命科学计划“从基因组到生命”（GTL，2003-2010）测序的费用（每个碱基 / 美元）测定的碱基序列总数 （十亿）人类基因组计划（1990-2003）3.16×109 bp中国人基因组炎黄一号基于基因组的个体化医学罕见疾病风险 查出孟德尔疾病致病基因 早期疾病预测 孕前/胚胎植入前筛查常见疾病风险 风险预测 风险分层 查出早期的行为异常风险显现药物基因组学 风险分层 药物效应和剂量 不良反应预测基于基因组的个体化医学基因组遗传分析GWASPGx