核酸序列的获取与比对实验课三.pptVIP

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  • 2023-05-01 发布于广东
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核酸序列的获取与比对实验课三;上机练习内容;1 复习:核酸序列提取;2 多重序列比对;;;GATGGGATTGGGGgTTTTCCCCTCCCATGTGCTCAAGAgCTGGCGCTAAAAGTTTTGAGCTTCTCAAAAGTC TAGAGCCACCGTCCAGGGAGCAGGTAGCTGCTGGGCTCCGGGGACACTTTGCGTTCGGGCTGGGAGCGTG;第八页,共六十三页,2022年,8月28日;2 多重序列比对;Multiple Sequence Alignment (MSA) ();多用于蛋白质序列比对;多用于核酸序列比对;;111 AATTCCGG 222 CCGGAATT 333;第十五页,共六十三页,2022年,8月28日;;第十七页,共六十三页,2022年,8月28日;;第十九页,共六十三页,2022年,8月28日;第二十页,共六十三页,2022年,8月28日;第二十一页,共六十三页,2022年,8月28日;;Guide Tree;3 SNP序列获取;单核苷酸多态(Single Nucleotide Polymorphisms, SNPs)是人类染色体上(DNA 序列)的单个核苷酸的差异。; SNP所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异,可由单个碱基转换、颠换、插入或缺失引起,但通常所说的SNP是指转换或颠换。 转换:嘌呤被嘌呤或嘧啶被嘧啶

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