微生物学教学课件：第八章 微生物的生态.pptxVIP

第八章 微生物的生态; 研究生物与其周围生物和非生物环境之间 相互关系的一门科学。;生物圈（biosphere）;第一节 微生物在自然界中的分布;一、土壤微生物;土壤微生物的含量与功能;二、水体微生物;沿岸区;群落3：沉积物 无氧区：发酵的和 其他厌氧菌 共位群1 ： 甲烷细菌、 同型乙酸细菌 共位群2 ： 硫酸盐还原菌、 硫还原细菌; 海洋微生物; 海洋微生物碳泵理论;饮用水标准;建立水体病毒检测方法的必要性;通过噬菌斑间接检测病毒;水体中病毒检测;三、空气中的微生物;;雾霾中的微生物;四、工农业产品上的微生物;霉腐微生物的危害方式;“菌灾”预防;;五、极端环境下的微生物;;嗜酸微生物 (acidophiles) 最适pH4 ;嗜盐微生物 (halophiles) 最适盐度12-32%;极端微生物;古古生菌界;六、人体正常菌群;厚壁菌;微生态制剂;2皮肤物化特点 (pH, 油脂, 水分);疾病部位的主要微生物是否都是病原菌? 是否应该去除皮肤上的所有“病原菌”? ;第二节 微生物与生物环境间的相互关系;微生物与生物环境间关系;共生类型; 降解消化时间 降解效率(％) 牛瘤胃 24h～36h 60～90 堆 肥 6m～12m 60 土 壤 以年计 很低 ;;;PNAS 2014;111:14500-14505;寄生类型;拮抗;捕食;第三节 微生物的地球化学作用; 定义: (元素循环,物质循环) 在水环境、空气、岩石圈中通过物质的生化活性所引起的 物理移动和化学转换： C, H, O, N, S, P, … Fe, Mo, Mn, etc. ;食物链能量学;物质循环; 1. “快” 循环– 十年或更短 a. 储藏者: 大气, 海洋表面, 生物, 土壤 b. 转移: 光合作用, 呼吸作用, 矿物燃料燃烧 c. 生物过程占优势 ;一、 碳素循环;蓝细菌、 微藻;Methanogens (产甲烷菌） a. 古生菌 b. 氧化还原电位极低时有活性 – 350 to –450 mV c. Methano– ‘methane’ (CH4) –genesis ‘production’ ; Methanotrophs （甲烷氧化菌） ? 好氧的 a. 细菌类 ；CH4 作为能量来源 b. CH4 + 2 O2 ? 2 H2O + CO2 c. 有些可以使用其它的单碳组分作为能量来源 (甲醇, 甲酸盐, 一氧化碳, 其它) d. 专性好氧菌 (O2 是电子受体) e. 出现在产甲烷微生物上层???氧区 或者出现在高地土壤 , 大气中的甲烷是主要能量来源;;二、氮素循环;;;2、硝化作用 – 氨（NH3)氧化为 亚硝酸盐 (NO2-)和硝酸盐 (NO3-) ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????  ;氨氧化细菌和甲烷氧化菌的相互作用 代谢酶类相关 氨氧化细菌的酶 – 铵单加氧酶（ammonium monooxygenase） - 也可以氧化甲烷 甲烷氧化菌的酶 – 甲烷单加氧酶（methane monooxygenase） – 也可以氧化铵 甲烷和铵之间酶的竞争抑制作用 土壤中铵含量高时， 甲烷消耗降低。导致全球性的气体甲烷增加。 也有说：低浓度铵可以增加甲烷消耗。;异养的硝化作用 ： 某些细菌or真菌 – 没有能量产生 真菌: 曲霉Aspergillus 细菌: 节杆菌属Arthrobacter, 硫螺菌属 Thiosphaera (可以硝化和反硝化!) ; ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ? 厌氧过程 – NO3- 作为最终电子受体许多反硝化菌是兼性厌氧菌 ，当没有氧气时有无氧代谢的能