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核酸生物化学实验步骤
(一)酵母中RNA 的提取及紫外分光光度法测定核酸浓度
1.稀碱法提取酵母中RNA
实验原理:基于核酸不溶于乙醇。先用稀碱将酵母细胞裂解,采用酸中和,通过离心去除菌体
细胞的大碎片,采用乙醇可将上清液中的RNA 沉淀出来。该方法提取的核酸分子为变性失活
的RNA 。
操作方法:
(1)称取2 g 干酵母粉,放入 100 mL 烧杯中,加入20 mL 的1%氢氧化钠水溶液,搅拌30 min
(玻璃棒手动充分搅拌)。
(2 )30 min 后,向(1)中加入少量乙酸调节pH 至中性(切忌调节pH 低于3, RNA 的等电
点2-2.5 ),试纸检查。
(3 )将(2 )全部转移至离心管中,3800 rpm 离心10 min (最大装液量离心管体积的三分之二,
等分两个离心管进行离心)。弃沉淀(主要是细胞壁等碎片),留上清(含有RNA )。
(4 )将上清液转移至干净的100 mL 烧杯中,加入 15 mL 95% 的乙醇,充分混匀,静置10 min 。
(此时,大部分RNA 沉积于烧杯底部,转移时需要搅动,以免丢失RNA 。因此该步骤也可将
上清液直接转移到离心管,静置10 min 是必要的)
(5 )将(4 )转移至离心管,3800 rpm 离心5 min (一次离心管装不下,分两次离心),弃掉上
清液,用95% 乙醇重悬,离心洗涤2 次,每次95% 乙醇用量5 mL 。
(6 )将洗涤后的样品转移至干净的表面皿(已称重)上,95℃水浴蒸汽干燥(约10 min 左右),
称重计算干酵母中RNA 含量。
提取的RNA 重量(g )
( )
干酵母中RNA 含量 % = × 100%
干酵母重量(g )
2 .紫外吸收法测定提取RNA 干粉中核酸含量
实验原理:核酸分子在260 nm 处具有特异性吸收峰
试验方法:
(1)称取实验1 中提取的RNA 干粉20 mg ,加入少量0.5 mol/L 的氢氧化钠水溶液溶解,然后
加入去离子水,用50 mL 容量瓶定容,
(2 )以去离子水做空白,测260 nm 处的吸光度(A ),计算提取的RNA 干粉中核酸含量。
∆A260 (g )× V
( )
RNA 中核酸含量 μg/g = × (/)
0.024 × L × m
其中:
∆A260为RNA 溶解液在260 nm 处的吸光度;
L 为比色皿的光程(1 cm );
N 为稀释倍数;
0.024 为1 mL 溶液中含有1 μg RNA 的260 nm 处吸光度;
V 为RNA 溶解液的体积(mL );
m 为RNA 溶液中RNA 质量(g );
备注:
文献报道的酵母中RNA 含量为2.67~10% ,DNA 含量为0.03~0.516% ;
乙酸具有刺激性气味,调节pH 取用需小心;
RNA 干粉较难溶解,需用玻璃棒充分搅拌;
稀碱处理液离心结束后转移上清液时切忌将沉淀转移到烧杯中(影响核酸浓度);
预实验提取酵母中RNA 含量均值3.29%;
紫外分光光度计测量A260 时,如果吸光度过大,需用去离子水稀释处理,保证吸光度在0.2~0.8 。
(二)质粒DNA 琼脂糖凝胶电泳
1. 琼脂糖凝胶电泳
1) 20 ml 的1×TAE 缓冲液中加入0.2 g 琼脂糖(浓度为1%),摇匀,微波炉加热(注意!防止
突沸及胶液外溢)或沸水浴加热溶化;
2) 待手持胶液不烫手时(约50 ℃),加入2 μ l 荧光染料Goldview,混匀,倒入有机玻璃槽内,
插上齿梳使之
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