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一种BAM文件并行读取方法、系统及介质.pdfVIP

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  • 2023-05-29 发布于四川
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一种BAM文件并行读取方法、系统及介质.pdf

    本发明公开了一种BAM文件并行读取方法、系统及介质，本发明从待解析BAM文件中顺序读取压缩数据块，将上述压缩数据块按照预设规则进行分组，生成由分组压缩块组成的待解压队列；读取线程以分组压缩块为单位，并行从待解压队列中获取数据；读取线程对分组压缩块进行解压，并解析对应的BAM数据，直到将整个分组压缩块的数据解析完成生成解析数据块；合并解析数据块，完成BAM文件的读取，本发明通过多个线程同时处理分组后的数据块的解压和解析工作，提升了整个BAM文件读取的效率，同时将读取的压缩数据块按照预设规则分组，调

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