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六、dbEST 是EST数据库 网址是： 当前第31页\共有66页\编于星期四\12点 七、TRANSFAC 关于转录因子及其结合位点的数据库 网址为： 当前第32页\共有66页\编于星期四\12点 八、TRRD 真核生物转录调控数据库 网址： 当前第33页\共有66页\编于星期四\12点 九、 COMPEL 此数据库收集了脊椎动物在转录调节区的调节元件信息 网址：www.gene-regulation. 当前第34页\共有66页\编于星期四\12点 十、 CUTG 密码子使用频度表（CUTG），是通过Genbank中DNA序列统计出来的 网址： 当前第35页\共有66页\编于星期四\12点 第四节 蛋白质序列数据库 当前第36页\共有66页\编于星期四\12点 一、SWISS-PROT数据库 该数据库力图提供高水平的数据注释信息，包括对蛋白质功能、结构域的结构、蛋白质翻译后的修饰、突变体的描述。其目标是提供禁垦恩更详尽的、很少冗余的数据，而且数据库中的连接可以直结链接到其它资源上 数据库的网址为： 。 当前第37页\共有66页\编于星期四\12点 二、PIR数据库 PIR是国际上最大的公共蛋白质序列数据库，是一个全面的、经过注释的、非冗余的蛋白质序列数据库。所有的序列都经过整理，超过99％的序列已经按蛋白质家族分类，一半以上还按蛋白质超家族进行了分类 数据库网址为： 当前第38页\共有66页\编于星期四\12点 三、PROSITE数据库 收集了生物学有显著意义的蛋白质位点和序列模式，并能根据这些位点和模式快速可靠地鉴别一个未知功能蛋白的蛋白序列应该属于哪一个蛋白家族 网址为： 当前第39页\共有66页\编于星期四\12点 四、PRINTS数据库 是建立在蛋白质指纹技术之上的数据库。蛋白质序列指纹图谱是基于多序列的对比结果，它有比对结果得到一系列相当保守的序列模体构建而成，用来表示蛋白质家族特征 数据库网址为： 当前第40页\共有66页\编于星期四\12点 五、TrEMBL数据库 翻译的EMBL，是1996年创建并增补到SWISSPROT数据库中 序列是一些免疫球蛋白和T细胞受体、少于8个氨基酸的碎片、合成的序列、具有专利的序列和不能编码真正蛋白的密码子 网址为： 当前第41页\共有66页\编于星期四\12点 六、NRL-3D数据库 包含在PIR数据库中，从蛋白质结构数据库PDB中提取出来的序列构成的数据库库 网址为： 当前第42页\共有66页\编于星期四\12点 第五节 蛋白质结构数据库 当前第43页\共有66页\编于星期四\12点 除了生物序列数据库外，生物大分子的三维结构数据库是另一类重要的分子生物学数据库 蛋白质空间结构数据库是随着X射线晶体衍射分子结构测定技术出现而出现的数据库 PDB是一个重要的蛋白质结构数据库，在蛋白质序列数据库诞生之前的20世纪70年代就已经问世 PDB数据库网址为： 当前第44页\共有66页\编于星期四\12点 第六节 蛋白质结构分类数据库 PDB数据库中虽然有几千套数据，但其中许多突变体的结构，以及高度同源结构，蛋白质折叠模式是有限的，最著名的结构分类数据库是英国研究小组建立的，分别是SCOP和CATH SCCP：. CATH: 当前第45页\共有66页\编于星期四\12点 第五节 常用生物软件 当前第46页\共有66页\编于星期四\12点 一、Primer Premier5.0 Primer Premier5.0是由加拿大的Premier公司开发的专业用于PCR或测序引物以及杂交探针的设计，评估的软件可以进行引物设计窗口、酶切分析、基元分析（Motif） 当前第47页\共有66页\编于星期四\12点 药物生物信息学详解演示文稿 当前第1页\共有66页\编于星期四\12点 （优选）药物生物信息学 当前第2页\共有66页\编于星期四\12点 一、概念 生物信息学随着人类基因组计划的全面开展和深入而出现的一门新兴的学科 2004年2月已经有170多个生物的基因组被测定，核苷酸数目达到200亿 对这些数据进行处理分析就必须发展新的分析理论、方法、技术和工具，所以必须依赖计算机的信息处理 当前第3页\共有66页\编于星期四\12点 生物信息学就是在上述背景下发展起来的综合应用生物学、数学、物理学、信息学、计算机科学等诸多学科的理论方法的崭新交叉学科，它研究的材料是生物学数据库，而采用的方法则是从计算机技术衍生而来的 基因组学和生物信息学的研究也改变了新药开发的思路和模式 当前第4页\共有66页\编于星期四\12点 对基因组计划产生的核酸序列分析一方面可以从本质上认识疾病尤其是遗传疾病的发生原因，为这些疾病的诊断、预防和治