蛋白预测转录后修饰及其相互作用.pptxVIP

蛋白预测转录后修饰及其相互作用;转录后修饰预测;蛋白质合成后的分泌及加工修饰 ;运输标签---信号肽 ;第5页/共67页;信号肽一级结构特征 一般由10多个至40多个氨基酸残基组成，大致分为三个区段。 N端有带正电荷的氨基酸，如赖氨酸和精氨酸，称为碱性氨基末端。中间较大的或更多的以中性氨基酸为主组成疏水核心区，常见有亮氨酸、异亮氨酸等。 C端含有小分子如甘、丙、丝氨酸较多，是被信号肽酶剪切的部位，称为加工区。 ;;;第9页/共67页;第10页/共67页;第11页/共67页;;信号肽预测结果;;练习;在ncbi上检索x56832;MAMQKIFAREILDSRGNPTVEVDLHTAKGRFRAAVPSGASTGIY EALELRDGDKGRYLGKGVLKAVENINNTLGPALLQKKLSVVDQEKVDKFMIELDGTEN KSKFGANAILGVSLAVCKAGAAEKGVPLYRHIADLAGNPDLILPVPAFNVINGGSHAG NKLAMQEFMILPVGASSFKEAMRIGAEVYHHLKGVIKAKYGKDATNVGDEGGFAPNIL ENNEALELLKTAIQAAGYPDKVVIGMDVAASEFYRNGKYDLDFKSPDDPARHITGEKL GELYKSFIKNYPVVSIEDPFDQDDWATWTSFLSGVNIQIVGDDLTVTNPKRIAQAVEK KACNCLLLKVNQIGSVTESIQACKLAQSNGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQ IKTGAPCRSERLAKYNQLMRIEEALGDKAIFAGRKFRNPKAK 变成fasta格式;烯醇化酶x56832;;;蛋白质翻译后加工修饰 ;1.氨基端和羧基端的修饰 2.共价修饰 许多的蛋白质可以进行不同的类型化学基团的共价修饰，修饰后可以表现为激活状态，也可以表现为失活状态。 （1）磷酸化： 磷酸化多发生在多肽链丝氨酸，苏氨酸的羟基上，偶尔也发生在酪氨酸残基上，这种磷酸化的过程受细胞内一种蛋白激酶催化，磷酸化后的蛋白质可以增加或降低它们的活性，例如：促进糖原分解的磷酸化酶，无活性的磷酸化酶b经磷酸化以后，变居有活性的磷酸化酶a。而有活性的糖原合成酶I经磷酸化以后变成无活性的糖原合成酶D，共同调节糖元的合成与分介。 S: CH2OHCH(NH2)COOH Y: T: CH3CH(OH)CH(NH2)COOH ;（2）糖基化： 质膜蛋白质和许多分泌性蛋白质都具有糖链，这些寡糖链结合在丝氨酸(S)或苏氨酸(T)的羟基上，例如红细胞膜上的ABO血型决定簇。也可以与天门冬酰胺(N)连接。这些寡糖链是在内质网或高尔基氏体中加入的;（3）羟基化： 胶原蛋白前α链上的脯氨酸和赖氨酸残基在内质网中受羟化酶、分子氧和维生素C作用产生羟脯氨酸和羟赖氨酸，如果此过程受障碍胶原纤维不能进行交联，极大地降低了它的张力强度。 （4）二硫键的形成：;糖基化修饰位点;;去uniprot上查询一个序列P00533 生长因子受体;;数据库中的糖基化位点;以FASTA格式输入;糖基化位点用颜色表示出来;另一种表达方式;以列表形式给出结果;结果说明;;练习;O-糖基化;O-糖基化预测;P00533 生长因子受体;粘蛋白（mucin）是上皮粘液的主要成分，具有高分子量和高糖基化，糖链占其分子量的50%-90%，富含O糖基化;;;;;练习 ;CD43;;;CD82;;;蛋白质之间的相互作用;;;;第56页/共67页;;;;不同颜色的线条表示相关可能性的大小，鼠标指处有相关性值;;;预测CD82都跟那些分子相互作用;;;;感谢您的欣赏