《遗传学》课件-第3章基因组.pptxVIP

第三章 基因组;本节内容;基因组(genome)概念;基因组(genome)概念;1.1 基因组的大小;不同物种基因组的大小与长度;万;;;人类基因组：30亿碱基;1.2 C值;1.3 C值与进化的关系;1.4 C值悖论;1.5 C值悖论的成因之一;基因的特性;1.5 C值悖论的成因之二;2.1 DNA复性动力学 ;2.2 C0t曲线;2.3理想反应曲线;2.4 C0t ?与分子量及复杂性的关系;2.5 C0t ?与重复序列的关系;2.5 C0t ?与重复序列的关系;2.5实例;3.1 基因组学;3.2 结构基因组学;3.2 结构基因组学－1;3.2 结构基因组学－2;3.3 结构基因组学常用研究方法;3.4 功能基因组学;3.4 功能基因组学-1;3.4 功能基因组学-2;3.4 功能基因组学-3;3.4 功能基因组学-4;比较基因组学;4.1 遗传多态性;4.1 遗传多态性;4.1 遗传多态性;4.2遗传标记（Genetic marker);1、形态学标记(morphological marker);伯乐相马;2、细胞遗传标记;G带显示人类男性的核型;细胞遗传标记的特点;3、生化与免疫遗传标记;同工酶与等位酶;等位酶分析的过程;生化与免疫遗传标记的特点;4、分子遗传标记;分子遗传标记的特点;5、理想的分子遗传标记应具备的特点;4.3 几种重要的分子标记－RFLP;RFLP的特点;PCR－RFLP;PCR－RFLP的应用;4.3 几种重要的分子标记－ DFP;DNA指纹图谱原理;VNTR变异的原理示意图;DFP的特点;4.3 几种重要的分子标记－RAPD;4.3 几种重要的分子标记－SSR;其二：SSR（simple sequence repeats)标记: 简单重复序列多态性。又称微卫星DNA多态性，即由二核苷酸，三核苷酸或四核苷酸串联重复的拷贝数目不等而出现的多态现象。 原理：以微卫星DNA标记两侧特异性序列设计专一引物，通过PCR技术扩增微卫星片段，扩增产物经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，不同个体间因核心序列的重复次数不同而产生DNA多态性。;微卫星遗传标记示意图;微卫星遗传标记示意图的特点;微卫星标记的应用领域;Huntington’s disease Huntingtin gene of unknown (!) function Repeats #: 6-35: normal; 36-120: disease ;4.3 几种重要的分子标记－STS;4.3 几种重要的分子标记－AFLP SNP;单核苷酸多态性标记(SNP);SNP标记的特点;4.4 DNA分子标记技术比较;5、遗传标记在基因谱图构建中的应用;遗传标记;多态性（polymophism）;形态标记; 最早建立的果蝇连锁图，就是利用控制果蝇眼睛的形状、颜色，躯体的颜色、翅膀的形状等形态性状作为标记，分析它们连锁关系及遗传距离，绘制而成的。 控制性状的其实是基因，所以形态标记实质上就是基因标记。;果蝇连锁图;遗传图谱的构建方法 ;遗传标记的染色体定位;标记间的连锁分析;水稻遗传图;现有的人类遗传图谱;（2）物理图谱的构建;遗传图谱的缺陷;酵母遗传图与物理图比较;物理作图的方法;限制酶作图（restriction mapping）;限制酶作图（restriction mapping）;荧光原位杂交（fluorescent in situ hybridization，FISH）;多色荧光原位杂交（或称染色体涂抹）显示人染色体核型;荧光原位杂交（fluorescent in situ hybridization，FISH）;人类基因组物理图;遗传图与物理图的整合;基因组测序策略;鸟枪法（shotgun sequencing）;鸟枪法的优缺点;克隆重叠群法（clone contig）;两种基因组测序策略;The E.coli genome;功能基因组学;根据序列分析搜寻基因 ;同源查询;同源查询的依据;基因功能研究 ;基因功能研究;6 人基因组组构; 谢 谢！;表2－1 基因组大小;表2－1 基因组大小（续）;图2－1 A;图2－1B;图2－2;图2－3;图2－4 RNA splicing;图2－6;Isozyme;(B)VNTR;RFLP分析;RFLP标记位共显性标记;Southern blot;RAPD;STS;VNTS;AFLP;;SNP;连锁图谱;物理图谱;序列图谱;DNA 指纹图谱的共有带率 （Band-sharing，简称BS） 　　BS 的计算公式为： 　　BS=2NAB/（NA +NB ） 　　式中：NA 指个体A 的图带数，NB 为个体B 的图带数，NAB 指个体A 和个体B 共有的图 　　带数。