生信分析实例.docxVIP

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  • 2023-08-01 发布于天津
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大纲内容: ?什么是生物信息学? ?生物信息学的研究内容 ?生物信息学在病毒研究中的应用 基于核智酸序列分析 ?同源分析和检索 ?核昔酸序列的基本分析 ?基因结构分析 ? 电子克隆(e-PCR) ?利用EST数据库的重叠序列克隆新基因 ?核酸序列的电子基因定位(即:基因的染色体定位) ?基因的电子表达谱分析(新基因) 基于氨基酸序列分析 ?同源分析和检索 ?蛋白质理化性质分析 ?功能区域:疏水区、跨膜区、信号肽、螺旋卷曲等功能性特征 功能位点分析(Motif) ?结构域分析 ?空间结构预测 ?分子进化(系统发育) 实例分析: ORF预测及可靠性检验 设计引物:Primer Prenuer 5.0 评估引物质量:Oligo 6.65 或 Oligonucleotide Properties Calculator NCBI 的 BLAST 2 SEQUENCES 程序 httD:〃 www.ncbi.nlm.nih.qov/blast/bl2seq/wblast2.CQi 核昔酸序列= 氨基酸序列 制作密码子用法表 蛋白质理化性质分析 在线分析 ExPasy服务器上的ProtParam http:〃us?exDasy?o「q/tools/D「otparam?html 生物学软件 BioEdit 一氨基酸成分 Seqtools一亲、疏水性残基,蛋白溶解度 蛋白质功能性区域分析 疏水性分

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