一个毛竹典型LTR转座子的克隆鉴定及进化分析.pdfVIP

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2023-08-02 发布于陕西
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一个毛竹典型LTR转座子的克隆鉴定及进化分析.pdf

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33 3 第卷第期竹子研究汇刊 Vol． 33 ，No． 3 2 0 1 4 8 年月 JOUＲNAL OF BAMBOO ＲESEAＲCH Aug．，2 0 1 4 LTＲ、一个毛竹典型转座子的克隆鉴定及进化分析摘要 LTＲ反转录转座子普。 LTＲ遍存在于植物界中为了进一步了解反转录转座子及探索毛竹中 LTＲ，， LTＲ-structure 存在的可能具有潜在活性的反转录转座子研究借助毛竹基因组草图数据库通过软 LTＲ Ph-LTＲ1，， Ph- 件分析得到一个典型反转录转座子并对其进行鉴定及插入时间的估算结果表明 LTＲ 1 Ty3-gypsy ， 98． 78% ， 47． 9 属于类反转录转座子其两端长末端重复序列同源性高达插入时间约为，，。万年是一个自身具备转座条件的年轻反转录转座子并且极有可能具有潜在活性采用同源性搜索方 52 Ph-LTＲ1 ，， Ph- 法搜索到条家族元件并对这些元件结构及其所在基因组的位置进行分析结果表明 LTＲ 1 ， Ph-LTＲ1 。家族元件中存在大量缺失的元件且家族元件偏向分布于远离基因的区域研究结果为后续具有潜在活性的LTＲ反转录转座子转化拟南芥实验奠定了基础，Ph-LTＲ1 家族元件结构及进化分析促进了对于LTＲ反转录转座子在基因组进化角色的认识与理解。 ;LTＲ ;Ph-LTＲ1 ; ; 关键词毛竹反转录转座子活性进化 Cloning ，Characterization and Phylogenetic Analysis of a Typical Long Terminal Ｒepeat Ｒetrotransposon in Phyllostachys hetero