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ICS 65.020
B 39
安
徽
省 地
DB34
方 标 准
DB 34/T 3244—2018
霍山石斛分子鉴定技术规程
The technical specifications for molecular indentification of Dendrobium huoshanense C. Z. Tang et S. J. Cheng
文稿版次选择
2018 - 12 - 29 发布
2019 - 01 - 29 实施
安徽省市场监督管理局 发 布
I
DB34/T 3244—2018
前 言
本标准按照 GB/T 1.1-2009 给出的规则起草。
本标准由皖西学院提出。
本标准由安徽省林业标准化技术委员会归口。
本标准起草单位:皖西学院、霍山县石斛(灵芝)产业发展办公室。
本标准主要起草人:赵群、陈乃富、陈存武、韩邦兴、孙传伯、戴军、宋向文、陈乃东、姚厚军、 李世海。
1
DB34/T 3244—2018
霍山石斛分子鉴定技术规程
1 范围
本标准规定了霍山石斛(Dendrobium huoshanenseC. Z. Tang et S. J. Cheng)分子鉴定的术语 与定义、分子鉴定技术、资料记录和档案管理。
本标准适用于霍山石斛与河南石斛、细茎石斛、铁皮石斛、金钗石斛之间的定性分子鉴定。
鉴定材料包括以上各种石斛的根、茎、叶、花、果实以及干条、枫斗、切片和含有霍山石斛成分的 粉末。
2 规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件, 仅所注日期的版本适用于本文 件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
DB34/T 486 霍山石斛
3 术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1
特异性引物 specific primer
能特异性扩增霍山石斛 ITS 或 trnL-trnF DNA 片段的位点特异性鉴别引物。 3.2
标准物种的特异性扩增片段 the specific sequence of standard species
用特异引物 CP2s 和 CP2a 扩增出的霍山石斛 DNA 片段。
3.3
标准物种扩增片段的特异性位点 the specific site of the sequence of standard species 用特异性引物 HuoS 和 HuoA 扩增的片段中在 5’→ 3’ 方向第 56 位的碱基 G。
4 分子鉴定技术
4.1 仪器设备及试剂
仪器设备及试剂见附录A。
4.2 溶液配制
2
DB34/T 3244—2018
溶液配制方法见附录B。
4.3 引物
通用引物 TY2s: 5’- CGCCATATTGATTGACACG -3’
通用引物 TY2a: 5’- GGCAGCCAACGAGAAGA -3’
特异性引物 CP2s: 5’- TTCGTGGGATGGGGTTC -3’
特异性引物 CP2a: 5’- TGCACATCCGAGCCTGA -3’
特异性引物 HuoS: 5’- AAAAGGGATAGGTGC -3’
特异性引物 HuoA: 5’- GATTTGGGTTGTGATT -3’
4.4 操作程序
4.4.1 DNA 提取
4.4.1.1 取干燥样品 50 mg 或新鲜样品 100 mg。用 CTAB 法提取总 DNA。具体过程详见附录 C。
4.4.1.2 所获 DNA 质量能够符合 PCR 扩增需要的 DNA 提取方法都适用于本标准。
4.4.1.3 样品应符合 DB34/T 486 的规定。
4.4.2 PCR 扩增
4.4.2.1 反应体系
反应体系总体积为 25 μL,反应组分配制如下。
——DNA 模板 0.5 μL(5- 50 ng),上游引物 1 μL(10 pmol), 下游引物 1 μL(10 pmol) , 10×PCR Buffer 2.5 μL,MgCl2(25 mM)1.5 μL,dNTPs(10 mM)0.5 μL,Taq DNA 聚合酶 (5 U/μL) 0.5 μL,ddH2O 补足至 25 μL。
4.4.2.2 反应程序
反应程序可根据引物不同选下列程序中的一种。
——程序 1:95℃ 5 min、35 个循环(每个循环包括 95℃ 30 s,55℃ 30 s,72℃ 30 s) 、72℃ 10 min。所用引物为通用引物 TY2s 和 TY2s。
——程序 2:95℃ 5 min、45 个循环(每个循环包括 95℃ 30 s,60℃ 30 s,72℃ 30 s) 、72℃ 10 min。所用引物为特异性引物 CP2s 和 CP2a。
——程序 3:95℃ 5 min、3
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