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1株克氏原螯虾细菌分离株的分离鉴定及抑菌活性研究
1 材料和方法
1.1 药敏纸片的制备
生病克氏原虾来自湖北省潜江市的一个农场。作者所在实验室的临床试验基地已购买药品敏洁纸。杭州微生物试剂有限公司购买脑心提取物和mh培养基,青岛海博生物科技有限公司购买天然化合物。从四川维奇公司购买天然化合物。从pcr批评器、细菌基因提取试剂盒和其他生物学试剂,购买南京诺威赞公司。
1.2 动物细胞培养
取患病克氏原螯虾,在无菌工作台中用无菌生理盐水冲洗体表3~5次后剖取其肝胰腺。肝胰腺经无菌生理盐水冲洗后在匀浆器中匀浆,取匀浆液在脑心浸液(BHI)固体培养基上划线,28 ℃培养箱中静置培养16~20 h。从长好细菌的平板挑取单菌落继续划线2~3次对细菌进行纯化,纯化好的细菌标记为Q并制备甘油菌保存于-80 ℃。
1.3 回归感染试验
Q离株单菌落在BHI液体培养基培养至对数生长中期后采用麦氏比浊法将菌液浓度调整至1.5×10
1.4 生化鉴定试剂条
首先取单菌落进行革兰氏染色后镜检,观察分离株的形态特征。此外,采用API20E生化鉴定试剂条进行生化鉴定。参照试剂条说明书,从平板上挑取菌落用无菌生理盐水稀释至合适浓度后加入试剂条各个孔中,在28 ℃条件下继续培养24 h后判定结果。
1.5 pcr扩增及测序
参照试剂盒说明书提取Q离株的全基因组,以其为模板通过PCR的方法扩增分离株16S rRNA片段,PCR上游引物(16S rRNA-F):5′-AGAGTTTGATCATGGCTC-3′,下游引物(16S rRNA-R):5′-TACGGTTACCTTGTTACGACTT-3′。扩增后得到的PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳鉴定后取目的条带进行凝胶回收并测序。将测序结果用Blast软件分析同源性并采用MEGA5.1软件以邻接法构建进化树,校正模型为Kimura 2-parameter,通过Bootstraps法自举数集1 000次。
1.6 离心收集菌体
从BHI平板上挑取Q离株的单菌落至BHI液体培养基中,28 ℃培养至对数生长中期,离心收集菌体。菌体经无菌生理盐水洗涤3次后采用麦氏比浊法将菌液浓度调整为1.5×10
1.7 联合感染试验
采用棋盘法研究多西环素和10种不同天然化合物联合后对Q离株的联合抑菌作用
2 结果与分析
2.1 革兰氏染色及显微镜检
从患病克氏原螯虾肝胰腺纯化的优势菌在BHI固体培养基上形成白色半透明的光滑菌落,革兰氏染色后经显微镜镜检发现该菌株为革兰氏阴性短杆状细菌。
2.2 感染虾的死亡情况
将Q离株以注射方式感染健康的克氏原螯虾,发现感染后的克氏原螯虾出现了活力下降等症状,且感染虾出现了不同程度的死亡,死亡率与感染剂量呈正相关,在感染试验过程中阴性对照组未出现发病和死亡情况(表1)。进一步剖检发现,感染后的克氏原螯虾肝胰腺发白甚至水肿,肌肉发白。此外,从症状明显的感染虾肝胰腺中分离到了1株优势菌,其培养特性与分离株Q本一致。经Bliss法计算得到该菌株对克氏原螯虾的半数致死浓度LC
2.3 生化特征分析
采用API20E细菌鉴定试纸条和ATB细菌鉴定系统分析了分离株Q生化特征,结果如表2所示。经ATB系统判定该菌株的生化特征与系统中摩氏摩根菌的特征相符合,其相似度为99.9%。
2.4 摩氏犯罪菌株与摩氏犯罪的序列比对
通过PCR方法得到了分离株Q16S rRNA片段,其长度约为1.5 kb。将测序结果提交至Blast软件与GenBank中已知序列比对发现,该菌株与摩氏摩根菌的同源性大于99%。通过MEGA软件构建发育树(图1)发现,分离株QMT890001)与摩氏摩根菌(AY464464.1)亲缘关系较近,结合该菌株的生理生化特征将Q株鉴定为摩氏摩根菌。
2.5 种化学药物的敏感性
采用K-B法检测了Q离株对20种化学药物的敏感性,结果发现,分离株对妥布霉素、新霉素、亚胺培南等7种药物敏感,对卡那霉素中度敏感,对庆大霉素、链霉素、头孢唑啉等12种药物耐药(表3)。
2.6 不同植物基质酚对菌株生长的影响
从表3可见,Q株对多西环素不敏感,多西环素对Q株的最小抑菌浓度为64 μg/mL(表4)。受试天然化合物血根碱、和厚朴酚、二氢辣椒碱和异土木香内酯对菌株 Q生长均有一定的抑制作用,其MIC分别为16、64、32和64 μg/mL (表4)。而当多西环素与天然化合物联合使用后仅二氢辣椒碱与多西环素具有协同抑制QJ20
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