遗传咨询师课件---高通量测序技术的发展及在临床应用-罗海涛、赵屹.pptxVIP

;赵屹，从事生物信息学研究15年，在长非编码RNA领域及多组学测序分 析方面有丰富的经验，以责任作者发表SCI论文20余篇， 总共引用次数超过600次。 与陈润生院士共同开发的非编码RNA数据库-NONCODE，已升级完成四个版本，是目前国际上非编码RNA相关的最全面的数据库之一。 在国际上首次开发了长非编码RNA功能预测系统-ncFANs，实现了对长非编码RNA基因的大规模功能预测。 在癌症的基因组测序，转录组测序等领域也取得多项高水平成果。;;;;;;;;;;;;;;;;;示;;;;;;;;;;;;DNA拷贝数变异 CNV DNA结构变异 SV;;;;;Germline variant：与生俱来的与参考基因组不同的基因组位点； Somatic variant：后天环境中新产生的基因组变异位点；;;;;;;;;;;高通量测序技术的临床应用;在NIPT中， 目前应用比较成熟的技术为胎儿染色体非整倍体诊断。通过全基因组重测序技术检测母亲血浆中胎儿游离DNA ，为唐氏综合征 (21三体综合征) ，爱德华氏综合征 (18三体综合征) ，帕陶氏综合征 (13三体综合征) 的诊断提供更加准确有效的诊断方法。同时避免了传统侵入性产前检测 (如羊膜腔穿刺，绒毛膜取样，脐带血取样等) 给孕妇和婴儿带来的损害 。;高通量测序技术的临床应用;高通量测序技术的临床应用;;肿瘤诊断与治疗 肿瘤是由基因组的突变积累引起的。通过第二代测序，对癌基因组序列和结构的分析可以为了解癌症机制、诊断与治疗提供新的视野。对肿瘤患者，采用全基因组测序技术检测肿瘤相关基因，可根据患者的个体差异性，辅助医生选择合适的治疗药物、制定个体化的治疗方案，延长患者生存时间，提高生活质量。;; 全基因组测序分析耗时7 周 发现bcr3 PML- RARA融合基因( 此患者ins( 1 7 ; 1 5 ) 非常小， 是常规FISH检测不到的);案例分享： 一位47岁患有肝内胆管癌(ICC)的女性，通过高通量测序手段对其肝内胆管癌细胞进行测序，发现了肿瘤细胞存在BRAF的突变，这个突变会引起细胞异常生长。通常BRAF突变与黑色素瘤相关。于是，医生开了通常用于治疗黑色素瘤的达拉菲尼胶囊和曲美替尼联合用药，这两种药物是专门针对这种类型BRAF突变的。目前，这名女性患者的许多症状已经消失， 治疗过程中的痛苦也减轻了很??。 Loaiza B. et al 《癌症医学科学》;骨肉瘤病人经全基因组测序发现11号染色体70.7Mb-71.8Mb区段出现780kb片段缺失，导致染色体重排 的出现; 巢式PCR扩增染色体重排区域； 骨肉瘤病人经一线化疗异环磷酰胺、阿霉素和二线化疗硼替佐米化疗后， 第14周血浆中肿瘤DNA水平明 显上升，并伴有疼痛症状，而后几周DNA水平持续增加， 第17周时CT确诊为广泛的软组织转移 McBride, D. J. , et al. , Use of cancer- specific genomic rearrangements to quantify disease burden in plasma from patients with solid tumors. Genes Chromosomes Cancer, 2 0 1 0 . 4 9 ( 1 1 ) : p. 1 0 6 2 - 9.;高通量测序非常适合细菌， 真菌和病毒等微生物的全基因组测序， 可用于这些微生物 感染导致的疾病， 可对微生物进行鉴定分型，了解感染的类型， 以达到预防和诊断的目的。测序可同时给出微生物的耐药性的信息， 指导个体用药。尤其是对于罕见感染性疾病的诊断;医生依据上述的判断，给予男孩青霉素治疗;高通量测序技术的临床应用;高通量测序技术的临床应用;高通量测序技术的临床应用;高通量测序技术的临床应用;;;