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- 2023-11-03 发布于上海
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中国沿海头足类DNA条形码与分子系统发育研究的中期报告
本研究旨在通过分析中国沿海区域头足类动物的DNA条形码序列,揭示不同物种之间的遗传关系和进化历史。在研究中期阶段,我们已经完成了以下工作:
1. 样本采集和DNA提取:我们从中国南海、东海和黄海的不同海域采集了头足类动物的样本,并使用基因组DNA提取试剂盒进行DNA提取和纯化。
2. DNA条形码构建:使用Illumina Miseq测序平台进行扩增子测序,得到了近100个物种的COI基因DNA条形码序列。我们使用BioEdit、Clustal X和MEGA对序列进行处理和比对,分析序列的进化关系和多样性。
3. 分子系统发育分析:基于COI条形码序列,我们使用MrBayes进行贝叶斯推断分析和PhyML进行最大似然估计分析,构建了头足类动物的系统发育树。结果表明,不同的物种之间具有明显的遗传差异和分类关系,有些物种之间的亲缘关系可能受到环境因素的影响。
4. 进一步分析:除了上述工作,我们还将进一步分析条形码序列的多样性、物种分布和进化历史等方面的问题,以更好地了解中国沿海头足类动物的遗传多样性和生态学特征。
总之,我们的研究将为中国沿海头足类动物的分类学、生态学和保护生物学研究提供重要的分子遗传学数据支持。
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