《生物信息学》试卷(A) .pdfVIP

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====Word 行业资料分享--可编辑版本--双击可删==== 武汉大学 2007—2008 学年度 高校教师研修班 《生物信息学》试卷(A )及答案 一、 翻译下列名词并解释。 (每题 5 分,共 25 分) 1. EST 2. ORF 3. BLAST 4. ANN 5. HGP 二、填空(每空 2 分,共 20 分) 1、蛋白质空间结构测定常用的方法有 和二维核磁共振技术。 2、BLAST 对序列格式的要求是常见的 格式。 3、系统发育树由一系列 和 组成,其中每个 代表一个分类单元,而 代表物种之间的进化关系。 、 、 等。 6. 目前已经是最广泛使用的系统发育程序。 三、解释说明: 请按要求对下列 GenBank 文件作解释说明。(每小题 4 分,共 20 分) 源-于-网-络-收-集 ====Word 行业资料分享--可编辑版本--双击可删==== 1、LOCUS 行中的第 3 项 mRNA linear 表示 ,这里是 。 2、DEFINITION 行在 GenBank 记录中用以 3 ACCESSION 是 ,是从数据库中检索一个记录的主要 。 4. FEATURES 后面部分是 ,直接表达了记录的生物背景知识, 5 CDS 30…533 表示 。 四、问答。(共35 分) 1 简述国际上有哪几个著名的核酸序列数据库? (10 分) 2 何谓序列比对的相似性和同源性,它们之间有何联系和区别(10 分) 3 试述发现基因的一般过程(15 分) 《生物信息学》试卷(A )答案 一、 翻译下列名词并解释。 (每题 5 分,共 25 分) 1. EST expressed sequence tag 表达序列标签 2. ORF Open Reading Frame, 开放阅读框 源-于-网-络-收-集 ====Word 行业资料分享--可编辑版本--双击可删==== 3. BLAST Basic Local Alignment Search Tool 局部相似性基本查询工具 4. ANN Artificial Neural Network, 人工神经网络 5. HGP Human genome project 人类基因组计划 二、填空(每空 2 分,共 20 分) 1、蛋白质空间结构测定常用的方法有 X 射线晶体衍射法和二维核磁共振技术。 2、BLAST 对序列格式的要求是常见的 FASTA 格式。 3、系统发育树由一系列节点和分支组成,其中每个节点代表一个分类单元,而节点之间 的连线代表物种之间的进化关系。 统计方法进行蛋白质结构预测包括经验性方法、结构规律提取方法、同源模型化方法等。 5. PHYLIP 目前已经是最广泛使用的系统发育程序。 三、解释说明:请按要求对下列 GenBank 文件作解释说明。(每小题 4 分,共 20 分) 1、LOCUS 行中的第 3 项 mRNA linear 表示生物分子的类型,这里是单链的 mRNA。 2、DEFINITION 行在 GenBank 记录中用以总结记录的生物意义 3 ACCESSION 是检索号 ,是从数据库中检索一个记录的主要关键词。 4. FEATURES 后面部分是特性表,直接表达了记录的生物背景知识 ,

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