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基于语义相似性和等级结构数据计算基因间表型相似性的中期报告 本文旨在介绍基于语义相似性和等级结构数据计算基因间表型相似性的中期进展。我们的研究目标是开发一种方法来评估基因间表型相似性，以帮助挖掘和理解基因功能，从而促进人类相关疾病的预测和治疗。 我们的研究方法基于以下主要想法：首先，我们从人类表型本体库（Human Phenotype Ontology，HPO）中捕获人类表型信息，并利用HPO中的概念之间的关系来构建等级结构数据。其次，我们将这些等级结构数据与基因信息进行整合，并计算基因之间的语义相似性。最后，我们通过比较这些相似性分值，来评估基因之间的表型相似性。 我们已经完成了以下工作：首先，我们利用HPO构建了一个人类表型网络，并将其用于计算基因之间的语义相似性。我们还开发了一种新的相似性度量方法，该方法考虑了等级结构数据的特点，并在实验中表现出良好的性能。此外，我们还开发了一个基于Web的应用程序，使研究者可以轻松地比较和分析基因之间的表型相似性，并获得关于相关疾病和通路信息的额外注释。 目前，我们正在进行以下工作：首先，我们将扩展我们的方法，以允许对不同物种的基因进行比较。其次，我们计划进一步验证和优化我们的算法，并将其应用于实际的基因研究和功能预测中。最后，我们将继续改进我们的应用程序，并添加更多的功能来帮助研究人员更好地理解基因和表型之间的关系。 总之，我们的研究旨在利用语义相似性和等级结构数据来计算基因间表型相似性，以帮助理解基因功能和相关疾病，从而促进治疗和预测。我们相信，这种基于HPO的方法可以为基因研究和医学实践提供有价值的信息和洞察。