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P-value: 学生分布 1. 一般选择双尾分布 2. 异方差双样本检验 3. Excel函数：=TTEST(B2:D2,E2:G2,2,3) 4. C：对照组；T：实验组 C1 C2 C3 T1 T2 T3 TTEST Gene 1 1.322 1.676 1.457 3.526 4.234 3.879 0.001988 本文档共55页；当前第31页；编辑于星期二\18点46分 Multiple Comparisons 1. 在基因芯片的实验中，每一个基因/探针，都是一个独立的实验 2. 基因芯片：高通量，1,000个基因/探针 3. 因此，无论怎么比较，总会有一些基因会是统计显著性差异表的 —— 可能是随机产生的 4. 如何评估表达差异基因预测的有效性？ 5. 例：1,000个探针的双通道芯片，以p-value 0.01为域值，发现7个上调基因，5个下调基因，分析结果是否具有统计学意义？ 本文档共55页；当前第32页；编辑于星期二\18点46分 False Discovery Rate (FDR) 1. False positive prediction: “Type 1 error or False Discovery 2. False Discovey Rate (FDR) = p-value * No. of Genes 上例： FDR= 0.01* 1,000=1