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;; ;二、病毒分类原理及其依据;第三章 病毒的结构极其基因组;三、病毒的内含物;;;;第三节 病毒基因组的复制与调控;四、dsRNA病毒基因组的复制; 病毒基因病毒包括mRNA转录和蛋白质翻译两个不同的过程。首先以病毒基因组核酸(DNA或RNA)为膜板,在病毒或宿主特异性RNA聚合酶的作用下,依照碱基配对互补的原则,转录生成病毒mRNA,然后这些转录生成的mRNA携带病毒的基因信息,进入宿主细胞的核搪体上,再经过翻译,合成病毒蛋白外,还有病毒基因组复制、转录所需的酶如复制酶、转录酶,,以及一种或几种调节蛋白,有包膜的病毒直至合成包膜糖蛋白。;; 腺病毒基因组DNA进入宿主细胞核后,首先启动早期转录,然后进行中期和晚期转录。在腺病毒的dsDNA中,3’-5’链称为γ链,转录方向从左到右;5’-3’链称为l,转录方向从右到左,早期转录除了出现在l链上外,也出现在γ链上,如 早期基因区E1A、E1B和E3在γ 链上转录,E2A、E2B和E4在l链上转录;晚期转录如L1、L2、L3、L4、L5基因区的转录均发生在γ 链上。;1、腺病毒的早期转录
E3基因区在76.6~86.2mu之间,其启动子在76.6mu处,该区至少转录6种mRNAs,它们分别编码14KD、14.7KD、11KD、10KD、16KD和19KD蛋白。虽然E3并非是病毒生长和复制所必须的,在缺少大部分或全部E3区的情况下,Ad仍能在组织培养上繁殖,但一些证据表明,E3区编码的19KD糖蛋白能够结合位于内质网中的MHC多肽的重链,并且阻止MHC进一步转移到细胞表面,从而降低细胞毒性T淋巴细胞对Ad感染靶细胞的识别。
2、腺病毒的晚期转录; 所谓非对称性转录是指病毒基因的转录并不固定在一条DNA链上,其中一些基因从一条链上转录,而另一些基因从另一条链上转录,因而使转录方向有左向和右向或者顺时针和逆时针的区别。;(四)病毒转录方式的差异;;;(二)真核DNA病毒基因转录的启动子与增强子;;3、增强子 是指能使与它连锁的上游或下游基因转录频率明显增强的DNA序列。在SV40基因组中首次发现了增强子,它位于SV40早期基因上游-250~-107bp,含有两个正向重复序列??每个长度为72bp,其核心序列为GGTGTGGAAAG。具有如下特点:
(1)转录增强效应明显,增强子一般能使基因转录频率增加10~200倍,有的可以增加上千倍。
(2)增强效应与位置和取向无关,不论增强子是在基因的上游或下游,均表现出增强效应。;;4、帽子位点 存在于启动子的下游,它是真核DNA病毒mRNA的转录起始位点,病毒基因转录模板链上帽子位点的碱基一般为T ,这样mRNA掺入的第一核苷酸就是ATP。;四、病毒的转录终止; 转录终止子有两种类型:一类是不依赖于蛋白辅助因子,即ρ因子的终止子;另一类是依赖于ρ因子的终止子从图可知不依赖ρ因子的终止子在结构上除了茎的长度不同外,都有富含GC区,而且茎-环结构之后都带有一个ploy(U)区;而依赖于ρ因子的终止子既缺少富含GC区,也无ploy(U)尾。; ;(一) 病毒mRNA 5’端的戴帽;(二)病毒mRNA3’端加ploy(A)尾;(三)病毒mRNA前体的拼接;译合成T抗原的量都大为减少,究其原因可能是由于宿主拼接酶系的作用还要求mRNA前体有特定的二级或三级空间构型的缘故,而维持这种空间构型则需要有内含子序列的存在。
在真核细胞中存在多种丰富的小分子叫做核内 小RNA(small nuclear RNA,snRNA),其中参与mRNA前体拼接的主要有U1、U2、U4、U5和U6 snRNA,这些snRNA经常与核内的几种蛋白质结合形成核内小核糖核蛋白( small nuclear ribonuleoprotein, snRNA),并与mRNA前体共同组成一个拼接体(spliceosome); 从上述可以看出,病毒mRNA前体的拼接既受控于宿主细胞的拼接系统,也需要有病毒自身编码的调节蛋白以及转录产生的“拼接RNA”起作用。;第二节 病毒蛋白的翻译及其翻译后加工;但其mRNA5’端的帽子结构可作为核糖体40S亚基以及起始因子eIF3、 eIF4B、 eIF4F、 eIF4A的识别和结合信号。一些研究还发现,真核病毒mRNA除了5’端帽子结构与病毒蛋白合成起始有关外,在起始密码子子AUG附近可能亦存在与18rRNA3’末端互补的序列。
大多数噬菌体和真核病毒蛋白翻译是从mRNA上的起始密码子AUG起始的,但副粘病毒P ORF mRNA上的AUG、GUG和ACG均
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