利用ssr标记构建湖南省审定的杂交水稻品种的dna指纹图谱.docxVIP

利用ssr标记构建湖南省审定的杂交水稻品种的dna指纹图谱 优良品种是确保水稻持续生产的物质基础，对品种的保护具有重要的现实意义。利用SSR标记鉴定水稻品种并建立指纹库的研究已有一定的基础,很多学者使用SSR标记建立了杂交稻或亲本的DNA分子指纹图谱[5,6,7,8,9,10,11,12,13]。但这些研究多倾向于利用DNA分子指纹图谱进行杂交稻种子纯度鉴定,很少从种质鉴定角度进行分析,加上不同研究利用的SSR引物和品种不同,相互之间缺乏可比性。本实验利用一套筛选的SSR引物构建湖南省审定的杂交水稻品种的DNA指纹图谱,用于水稻种质鉴定。 1 材料和方法 1.1 引物的筛选 目前,水稻基因组已经开发出2万多对SSR引物,参考国内外应用比较广泛的引物,在每条染色体上挑选部分多态性高、带型清晰稳定、带型统计容易、重复性好的的引物供筛选。 1.2 试验品种 收集了77个通过湖南省品种审定委员会审定的杂交水稻品种,这些品种曾经或正在生产上大面积应用推广。 1.3 dna提取、pcr和琼脂糖凝胶电泳 对传统CTAB和PCR程序进行了改进,利用4%的琼脂糖凝胶进行电泳。 2 结果与分析 2.1 ssr引物的制备 从每条染色体上选取10~12对SSR引物,通过对部分品种的PCR扩增,根据带型清晰、多态性高、基因组分布均衡的原则,每条染色体上分别取4对SSR引物,且尽量使得同一染色体上的4对引物