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- 2023-12-04 发布于广东
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末端限制性片段长度多态性技术在微生物群落结构分析中的应用
对于不依赖培养的遗传因素谱图(gfp)技术,微生物群落结构和动态分析已成为分子微生物生态的热点内容。其中,易变电阻梯度总理技术(d.tgge)、单链结构性多态性(sscp)和末端限制长度多态性(tslfp)的应用最为广泛。trfp是现有rv技术的扩展。李鹤首先将trv技术应用于微生物群落分析。与其他指纹跟踪技术相比,该技术具有以下优点:1)它具有高流量,可以快速生成大量重复、准确的数据,并用于研究微生物群落结构的时空演变。2)数据输出的形式允许快速分析大量信息。由于片段分析软件安装在dna测量序列中,这些软件可以自动生成电泳结果并以表格的形式输出,从而使用标准统计分析,因此可以避免生成原始指纹图的程序。3)通过将末端限制段(tr3)的长度与现有数据库进行比较,可以直接确定群落图中的单个细菌。4)由于生成trol-t的设备是一种测量发票,因此精度和分辨率高于其他方法生成的图。随着自动测序仪在国内实验室的普及,需要将这种快速、准确的群落分析技术引入实验,以提高群落分析技术在群落分析领域的应用。本文介绍了trv技术的基本原理和方法,重点介绍了微生物群落分析的应用过程,并对其存在的不足提出了解决方案。
1 trflp算法
TRFLP技术的原理如图1所示,采用一端荧光标记的引物进行PCR 扩增,PCR产物以识别4个碱基的限制性内切酶
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