演示文稿第三代基因测序原理及应用.pptVIP

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在单个碱基掺入增长的DNA链时检测它们。当每个dNTP加入时对荧光标记的终止子成像,随后切割,允许下一个碱基的掺入。由于每个测序循环中四种可逆终止子结合的dNTP都存在,所以自然竞争让掺入偏差最小化。根据每个循环的信号强度测定直接检出碱基,与其他技术相比大大降低了原始错误率。最终结果是高度准确的base-by-base测序,避免了序列内容特异的误差,实现了可靠的碱基检出,即使是那些重复序列区和均聚物。*(4)测序测序方法采用边合成边测序的方法。向反应体系中同时添加DNA聚合酶、接头引物和带有碱基特异荧光标记的4中dNTP(如同Sanger测序法)。这些dNTP的3’-OH被化学方法所保护,因而每次只能添加一个dNTP。在dNTP被添加到合成链上后,所有未使用的游离dNTP和DNA聚合酶会被洗脱掉。接着,再加入激发荧光所需的缓冲液,用激光激发荧光信号,并有光学设备完成荧光信号的记录,最后利用计算机分析将光学信号转化为测序碱基。这样荧光信号记录完成后,再加入化学试剂淬灭荧光信号并去除dNTP3’-OH保护基团,以便能进行下一轮的测序反应。*(4)测序测序方法采用边合成边测序的方法。向反应体系中同时添加DNA聚合酶、接头引物和带有碱基特异荧光标记的4中dNTP(如同Sanger测序法)。这些dNTP的3’-OH被化学方法所保护,因而每次只能添加一个dNTP。在dNTP被添加到合成链上后,所有未使用的游离dNTP和DNA聚合酶会被洗脱掉。接着,再加入激发荧光所需的缓冲液,用激光激发荧光信号,并有光学设备完成荧光信号的记录,最后利用计算机分析将光学信号转化为测序碱基。这样荧光信号记录完成后,再加入化学试剂淬灭荧光信号并去除dNTP3’-OH保护基团,以便能进行下一轮的测序反应。**(优选)第三代基因测序原理及应用本文档共21页;当前第1页;编辑于星期日\18点34分什么是DNA?DNA是英文Deoxyribonucleicacid的缩写,中文含义为脱氧核糖核酸。脱氧核糖核苷酸的类型:

腺嘌呤(A)=胸腺嘧啶(T)胞嘧啶(C)=鸟嘌呤(G)DNA分子的排列顺序是可以检测的,从而可以解读遗传信息,即测序。DNA结构(视频)本文档共21页;当前第2页;编辑于星期日\18点34分什么是基因?

基因是具有遗传效应的DNA分子片段,由许多脱氧核苷酸按照一定的碱基顺序构成的长链聚合物。基因身高肤色智商胖瘦本文档共21页;当前第3页;编辑于星期日\18点34分基因组:一个细胞内的全套染色体为一个基因组,或是一个细胞中的全部DNA为一个基因组什么是基因组?

基因组染色体基因本文档共21页;当前第4页;编辑于星期日\18点34分测序技术发展史本文档共21页;当前第5页;编辑于星期日\18点34分第一代测序原理-Sanger测序法双脱氧链终止法(Sanger法):1977年,英国人FredSanger发现,如果在DNA复制过程中掺入ddNTP,就会产生一系列末端终止的DNA链,并能通过电泳按长度分辨。不同末端终止DNA链的长度是由掺入到新合成链上随机位置的ddNTP决定的。本文档共21页;当前第6页;编辑于星期日\18点34分复制叉(Replicationfork)DNAligase:DNA连接酶;DNAgyrase:DNA旋转酶;DnaBhelicase:解旋酶SSB:单链结合蛋白;本文档共21页;当前第7页;编辑于星期日\18点34分DNA连接酶(DNAligase)功能:连接DNA链3‘-OH末端和另一DNA链的5’-P末端,使二者生成磷酸二酯键,从而把两段相邻的DNA链连成完整的链。DNA复制本文档共21页;当前第8页;编辑于星期日\18点34分Sanger测序法本文档共21页;当前第9页;编辑于星期日\18点34分第一代测序成果:人类基因组2001年2月份同时发表,从此有了人类基因组模板。本文档共21页;当前第10页;编辑于星期日\18点34分ATCGAACTTCCATTGCACCAATATAGGTACGTAAATCGAACTTCCTTGCACCTATATAGGTGTACGTAA参考序列:测序所得序列:碱基缺失碱基突变碱基重复特点:测序长度700-1000bp;通量小,一次96个样本,每个样本1条序列临床应用:单基因病检测,如血友病、白化病、地中海贫血等本文档共21页;当前第11页;编辑于星期日\18点34分第二代测序原理-高通量测序

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